DNAJC13

Ідентифікатори

Символи

DNAJC13, RME8, PARK21, DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13

Зовнішні ІД

OMIM: 614334 MGI: 2676368 HomoloGene: 13574 GeneCards: DNAJC13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• lysosomal membrane • ендосома • WASH complex • early endosome membrane • endosome membrane • екзосома • early endosome • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма • клітинна мембрана • secretory granule membrane • azurophil granule membrane
Біологічний процес	• protein transport • regulation of early endosome to late endosome transport • regulation of early endosome to recycling endosome transport • osteoblast differentiation • endosome organization • neutrophil degranulation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23317


235567

Ensembl


ENSG00000138246


ENSMUSG00000032560

UniProt


O75165


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_015268 NM_001329126 NM_173823


NM_001163026 NM_001359740

RefSeq (білок)


NP_001316055 NP_056083


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 3: 132.42 – 132.54 Mb

Хр. 9: 104.03 – 104.14 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DNAJC13 (англ. DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 243 амінокислот, а молекулярна маса — 254 415^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNIIRENKDL	ACFYTTKHSW	RGKYKRVFSV	GTHAITTYNP	NTLEVTNQWP
YGDICSISPV	GKGQGTEFNL	TFRKGSGKKS	ETLKFSTEHR	TELLTEALRF
RTDFSEGKIT	GRRYNCYKHH	WSDSRKPVIL	EVTPGGFDQI	NPATNRVLCS
YDYRNIEGFV	DLSDYQGGFC	ILYGGFSRLH	LFASEQREEI	IKSAIDHAGN
YIGISLRIRK	EPLEFEQYLN	LRFGKYSTDE	SITSLAEFVV	QKISPRHSEP
VKRVLALTET	CLVERDPATY	NIATLKPLGE	VFALVCDSEN	PQLFTIEFIK
GQVRKYSSTE	RDSLLASLLD	GVRASGNRDV	CVKMTPTHKG	QRWGLLSMPV
DEEVESLHLR	FLATPPNGNF	ADAVFRFNAN	ISYSGVLHAV	TQDGLFSENK
EKLINNAITA	LLSQEGDVVA	SNAELESQFQ	AVRRLVASKA	GFLAFTQLPK
FRERLGVKVV	KALKRSNNGI	IHAAVDMLCA	LMCPMHDDYD	LRQEQLNKAS
LLSSKKFLEN	LLEKFNSHVD	HGTGALVISS	LLDFLTFALC	APYSETTEGQ
QFDMLLEMVA	SNGRTLFKLF	QHPSMAIIKG	AGLVMKAIIE	EGDKEIATKM
QELALSEGAL	PRHLHTAMFT	ISSDQRMLTN	RQLSRHLVGL	WTADNATATN
LLKRILPPGL	LAYLESSDLV	PEKDADRMHV	RDNVKIAMDQ	YGKFNKVPEW
QRLAGKAAKE	VEKFAKEKVD	LVLMHWRDRM	GIAQKENINQ	KPVVLRKRRQ
RIKIEANWDL	FYYRFGQDHA	RSNLIWNFKT	REELKDTLES	EMRAFNIDRE
LGSANVISWN	HHEFEVKYEC	LAEEIKIGDY	YLRLLLEEDE	NEESGSIKRS
YEFFNELYHR	FLLTPKVNMK	CLCLQALAIV	YGRCHEEIGP	FTDTRYIIGM
LERCTDKLER	DRLILFLNKL	ILNKKNVKDL	MDSNGIRILV	DLLTLAHLHV
SRATVPLQSN	VIEAAPDMKR	ESEKEWYFGN	ADKERSGPYG	FHEMQELWTK
GMLNAKTRCW	AQGMDGWRPL	QSIPQLKWCL	LASGQAVLNE	TDLATLILNM
LITMCGYFPS	RDQDNAIIRP	LPKVKRLLSD	STCLPHIIQL	LLTFDPILVE
KVAILLYHIM	QDNPQLPRLY	LSGVFFFIMM	YTGSNVLPVA	RFLKYTHTKQ
AFKSEETKGQ	DIFQRSILGH	ILPEAMVCYL	ENYEPEKFSE	IFLGEFDTPE
AIWSSEMRRL	MIEKIAAHLA	DFTPRLQSNT	RALYQYCPIP	IINYPQLENE
LFCNIYYLKQ	LCDTLRFPDW	PIKDPVKLLK	DTLDAWKKEV	EKKPPMMSID
DAYEVLNLPQ	GQGPHDESKI	RKAYFRLAQK	YHPDKNPEGR	DMFEKVNKAY
EFLCTKSAKI	VDGPDPENII	LILKTQSILF	NRHKEDLQPY	KYAGYPMLIR
TITMETSDDL	LFSKESPLLP	AATELAFHTV	NCSALNAEEL	RRENGLEVLQ
EAFSRCVAVL	TRASKPSDMS	VQVCGYISKC	YSVAAQFEEC	REKITEMPSI
IKDLCRVLYF	GKSIPRVAAL	GVECVSSFAV	DFWLQTHLFQ	AGILWYLLGF
LFNYDYTLEE	SGIQKSEETN	QQEVANSLAK	LSVHALSRLG	GYLAEEQATP
ENPTIRKSLA	GMLTPYVARK	LAVASVTEIL	KMLNSNTESP	YLIWNNSTRA
ELLEFLESQQ	ENMIKKGDCD	KTYGSEFVYS	DHAKELIVGE	IFVRVYNEVP
TFQLEVPKAF	AASLLDYIGS	QAQYLHTFMA	ITHAAKVESE	QHGDRLPRVE
MALEALRNVI	KYNPGSESEC	IGHFKLIFSL	LRVHGAGQVQ	QLALEVVNIV
TSNQDCVNNI	AESMVLSSLL	ALLHSLPSSR	QLVLETLYAL	TSSTKIIKEA
MAKGALIYLL	DMFCNSTHPQ	VRAQTAELFA	KMTADKLIGP	KVRITLMKFL
PSVFMDAMRD	NPEAAVHIFE	GTHENPELIW	NDNSRDKVST	TVREMMLEHF
KNQQDNPEAN	WKLPEDFAVV	FGEAEGELAV	GGVFLRIFIA	QPAWVLRKPR
EFLIALLEKL	TELLEKNNPH	GETLETLTMA	TVCLFSAQPQ	LADQVPPLGH
LPKVIQAMNH	RNNAIPKSAI	RVIHALSENE	LCVRAMASLE	TIGPLMNGMK
KRADTVGLAC	EAINRMFQKE	QSELVAQALK	ADLVPYLLKL	LEGIGLENLD
SPAATKAQIV	KALKAMTRSL	QYGEQVNEIL	CRSSVWSAFK	DQKHDLFISE
SQTAGYLTGP	GVAGYLTAGT	STSVMSNLPP	PVDHEAGDLG	YQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

Girard M., Poupon V., Blondeau F., McPherson P.S. (2005). The DnaJ-domain protein RME-8 functions in endosomal trafficking. J. Biol. Chem. 280: 40135—40143. PMID 16179350 DOI:10.1074/jbc.M505036200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Girard M., McPherson P.S. (2008). RME-8 regulates trafficking of the epidermal growth factor receptor. FEBS Lett. 582: 961—966. PMID 18307993 DOI:10.1016/j.febslet.2008.02.042
Freeman C.L., Hesketh G., Seaman M.N. (2014). RME-8 coordinates the activity of the WASH complex with the function of the retromer SNX dimer to control endosomal tubulation. J. Cell Sci. 127: 2053—2070. PMID 24643499 DOI:10.1242/jcs.144659

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30343 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75165 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.