DPF1

Ідентифікатори

Символи

DPF1, BAF45b, NEUD4, neuro-d4, double PHD fingers 1, SMARCG1

Зовнішні ІД

OMIM: 601670 MGI: 1352748 HomoloGene: 3415 GeneCards: DPF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nBAF complex • клітинне ядро • histone acetyltransferase complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0097285 апоптоз • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8193


29861

Ensembl


ENSG00000011332


ENSMUSG00000030584

UniProt


Q92782 Q6PJ73


Q9QX66

RefSeq (мРНК)


NM_001135155 NM_001135156 NM_001289978 NM_004647 NM_001363579


NM_013874 NM_001368371

RefSeq (білок)

NP_001128627 NP_001128628 NP_001276907 NP_004638 NP_001350508
NP_001128628.1

NP_038902 NP_001355300 NP_001390134 NP_001390135 NP_001390136
NP_001390137 NP_001390138 NP_001390140 NP_001390141 NP_001390143 NP_001390144 NP_001390145 NP_001390146 NP_001390147 NP_001390148 NP_001390149 NP_001390139

Локус (UCSC)

Хр. 19: 38.21 – 38.23 Mb

Хр. 7: 29.3 – 29.32 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DPF1 (англ. Double PHD fingers 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 502^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGLSARPTA	GRTDPAGTCW	GQDPGSKMAT	VIPGPLSLGE	DFYREAIEHC
RSYNARLCAE	RSLRLPFLDS	QTGVAQNNCY	IWMEKTHRGP	GLAPGQIYTY
PARCWRKKRR	LNILEDPRLR	PCEYKIDCEA	PLKKEGGLPE	GPVLEALLCA
ETGEKKIELK	EEETIMDCQK	QQLLEFPHDL	EVEDLEDDIP	RRKNRAKGKA
YGIGGLRKRQ	DTASLEDRDK	PYVCDKFYKE	LAWVPEAQRK	HTAKKAPDGT
VIPNGYCDFC	LGGSKKTGCP	EDLISCADCG	RSGHPSCLQF	TVNMTAAVRT
YRWQCIECKS	CSLCGTSEND	GASWAGLTPQ	DQLLFCDDCD	RGYHMYCLSP
PMAEPPEGSW	SCHLCLRHLK	EKASAYITLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chestkov A.V., Baka I.D., Kost M.V., Georgiev G.P., Buchman V.L. (1996). The d4 gene family in the human genome. Genomics. 36: 174—177. PMID 8812431 DOI:10.1006/geno.1996.0440

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20225 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92782 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.