DPF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | DPF1, BAF45b, NEUD4, neuro-d4, double PHD fingers 1, SMARCG1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601670 MGI: 1352748 HomoloGene: 3415 GeneCards: DPF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • histone acetyltransferase activity • GO:0031493 histone binding • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • nBAF complex • клітинне ядро • histone acetyltransferase complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0097285 апоптоз • histone acetylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001135155 NM_001135156 NM_001289978 NM_004647 NM_001363579 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001128627 NP_001128628 NP_001276907 NP_004638 NP_001350508
| NP_001128628.1 |
| NP_038902 NP_001355300 NP_001390134 NP_001390135 NP_001390136
| NP_001390137 NP_001390138 NP_001390140 NP_001390141 NP_001390143 NP_001390144 NP_001390145 NP_001390146 NP_001390147 NP_001390148 NP_001390149 NP_001390139 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 38.21 – 38.23 Mb | Хр. 7: 29.3 – 29.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DPF1 (англ. Double PHD fingers 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 502[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGGLSARPTA | | GRTDPAGTCW | | GQDPGSKMAT | | VIPGPLSLGE | | DFYREAIEHC |
RSYNARLCAE | | RSLRLPFLDS | | QTGVAQNNCY | | IWMEKTHRGP | | GLAPGQIYTY |
PARCWRKKRR | | LNILEDPRLR | | PCEYKIDCEA | | PLKKEGGLPE | | GPVLEALLCA |
ETGEKKIELK | | EEETIMDCQK | | QQLLEFPHDL | | EVEDLEDDIP | | RRKNRAKGKA |
YGIGGLRKRQ | | DTASLEDRDK | | PYVCDKFYKE | | LAWVPEAQRK | | HTAKKAPDGT |
VIPNGYCDFC | | LGGSKKTGCP | | EDLISCADCG | | RSGHPSCLQF | | TVNMTAAVRT |
YRWQCIECKS | | CSLCGTSEND | | GASWAGLTPQ | | DQLLFCDDCD | | RGYHMYCLSP |
PMAEPPEGSW | | SCHLCLRHLK | | EKASAYITLT |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chestkov A.V., Baka I.D., Kost M.V., Georgiev G.P., Buchman V.L. (1996). The d4 gene family in the human genome. Genomics. 36: 174—177. PMID 8812431 DOI:10.1006/geno.1996.0440
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20225 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92782 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |