EDC3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VC8, 2WAX, 2WAY, 3D3J, 3D3K

Ідентифікатори

Символи

EDC3, LSM16, YJDC, YJEFN2, MRT50, enhancer of mRNA decapping 3, hYjeF_N2-15q23

Зовнішні ІД

OMIM: 609842 MGI: 2142951 HomoloGene: 11827 GeneCards: EDC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphodiesterase decapping endonuclease activity • identical protein binding • RNA binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • P-body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• P-body assembly • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80153


353190

Ensembl


ENSG00000179151


ENSMUSG00000038957

UniProt


Q96F86


Q8K2D3

RefSeq (мРНК)


NM_001142443 NM_001142444 NM_025083 NM_001351378 NM_001351379


NM_153799

RefSeq (білок)


NP_001135915 NP_001135916 NP_079359 NP_001338307 NP_001338308


NP_722494

Локус (UCSC)

Хр. 15: 74.63 – 74.7 Mb

Хр. 9: 57.62 – 57.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EDC3 (англ. Enhancer of mRNA decapping 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 56 078^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATDWLGSIV	SINCGDSLGV	YQGRVSAVDQ	VSQTISLTRP	FHNGVKCLVP
EVTFRAGDIT	ELKILEIPGP	GDNQHFGDLH	QTELGPSGAG	CQVGINQNGT
GKFVKKPASS	SSAPQNIPKR	TDVKSQDVAV	SPQQQQCSKS	YVDRHMESLS
QSKSFRRRHN	SWSSSSRHPN	QATPKKSGLK	NGQMKNKDDE	CFGDDIEEIP
DTDFDFEGNL	ALFDKAAVFE	EIDTYERRSG	TRSRGIPNER	PTRYRHDENI
LESEPIVYRR	IIVPHNVSKE	FCTDSGLVVP	SISYELHKKL	LSVAEKHGLT
LERRLEMTGV	CASQMALTLL	GGPNRLNPKN	VHQRPTVALL	CGPHVKGAQG
ISCGRHLANH	DVQVILFLPN	FVKMLESITN	ELSLFSKTQG	QQVSSLKDLP
TSPVDLVINC	LDCPENVFLR	DQPWYKAAVA	WANQNRAPVL	SIDPPVHEVE
QGIDAKWSLA	LGLPLPLGEH	AGRIYLCDIG	IPQQVFQEVG	INYHSPFGCK
FVIPLHSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26114 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96F86 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.