EFTUD2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EFTUD2, MFDGA, MFDM, SNRNP116, Snrp116, Snu114, U5-116KD, elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603892 MGI: 1336880 HomoloGene: 3133 GeneCards: EFTUD2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
mandibulofacial dysostosis-microcephaly syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • RNA binding • U5 snRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Тільце Кахаля • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • гіалоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type catalytic step 2 spliceosome • Рибонуклеопротеїни • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • response to cocaine |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001142605 NM_001258353 NM_001258354 NM_004247 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001136077 NP_001245282 NP_001245283 NP_004238 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 44.85 – 44.9 Mb | Хр. 11: 102.73 – 102.77 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EFTUD2 (англ. Elongation factor Tu GTP binding domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 972 амінокислот, а молекулярна маса — 109 436[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDTDLYDEFG | | NYIGPELDSD | | EDDDELGRET | | KDLDEMDDDD | | DDDDVGDHDD |
DHPGMEVVLH | | EDKKYYPTAE | | EVYGPEVETI | | VQEEDTQPLT | | EPIIKPVKTK |
KFTLMEQTLP | | VTVYEMDFLA | | DLMDNSELIR | | NVTLCGHLHH | | GKTCFVDCLI |
EQTHPEIRKR | | YDQDLCYTDI | | LFTEQERGVG | | IKSTPVTVVL | | PDTKGKSYLF |
NIMDTPGHVN | | FSDEVTAGLR | | ISDGVVLFID | | AAEGVMLNTE | | RLIKHAVQER |
LAVTVCINKI | | DRLILELKLP | | PTDAYYKLRH | | IVDEVNGLIS | | MYSTDENLIL |
SPLLGNVCFS | | SSQYSICFTL | | GSFAKIYADT | | FGDINYQEFA | | KRLWGDIYFN |
PKTRKFTKKA | | PTSSSQRSFV | | EFILEPLYKI | | LAQVVGDVDT | | SLPRTLDELG |
IHLTKEELKL | | NIRPLLRLVC | | KKFFGEFTGF | | VDMCVQHIPS | | PKVGAKPKIE |
HTYTGGVDSD | | LGEAMSDCDP | | DGPLMCHTTK | | MYSTDDGVQF | | HAFGRVLSGT |
IHAGQPVKVL | | GENYTLEDEE | | DSQICTVGRL | | WISVARYHIE | | VNRVPAGNWV |
LIEGVDQPIV | | KTATITEPRG | | NEEAQIFRPL | | KFNTTSVIKI | | AVEPVNPSEL |
PKMLDGLRKV | | NKSYPSLTTK | | VEESGEHVIL | | GTGELYLDCV | | MHDLRKMYSE |
IDIKVADPVV | | TFCETVVETS | | SLKCFAETPN | | KKNKITMIAE | | PLEKGLAEDI |
ENEVVQITWN | | RKKLGEFFQT | | KYDWDLLAAR | | SIWAFGPDAT | | GPNILVDDTL |
PSEVDKALLG | | SVKDSIVQGF | | QWGTREGPLC | | DELIRNVKFK | | ILDAVVAQEP |
LHRGGGQIIP | | TARRVVYSAF | | LMATPRLMEP | | YYFVEVQAPA | | DCVSAVYTVL |
ARRRGHVTQD | | APIPGSPLYT | | IKAFIPAIDS | | FGFETDLRTH | | TQGQAFSLSV |
FHHWQIVPGD | | PLDKSIVIRP | | LEPQPAPHLA | | REFMIKTRRR | | KGLSEDVSIS |
KFFDDPMLLE | | LAKQDVVLNY | | PM |
Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fabrizio P., Laggerbauer B., Lauber J., Lane W.S., Luehrmann R. (1997). An evolutionarily conserved U5 snRNP-specific protein is a GTP-binding factor closely related to the ribosomal translocase EF-2. EMBO J. 16: 4092—4106. PMID 9233818 DOI:10.1093/emboj/16.13.4092
- Achsel T., Ahrens K., Brahms H., Teigelkamp S., Luehrmann R. (1998). The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein. Mol. Cell. Biol. 18: 6756—6766. PMID 9774689 DOI:10.1128/MCB.18.11.6756
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EFTUD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30858 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q15029 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |