EGLN2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | EGLN2, EIT6, HIF-PH1, HIFPH1, HPH-1, HPH-3, PHD1, egl-9 family hypoxia inducible factor 2, EIT-6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606424 MGI: 1932287 HomoloGene: 14204 GeneCards: EGLN2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • L-ascorbic acid binding • iron ion binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • oxygen gasoreceptor activity • peptidyl-proline 4-dioxygenase activity |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • response to hypoxia • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • regulation of neuron apoptotic process • peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline • cell redox homeostasis • regulation of cell growth • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • intracellular estrogen receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/PBB_GE_EGLN2_220956_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_EGLN2_220956_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_080732 NM_017555 NM_053046 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 40.8 – 40.81 Mb | Хр. 7: 26.86 – 26.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EGLN2 (англ. Egl-9 family hypoxia inducible factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 43 650[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSPCQPQPL | | SQALPQLPGS | | SSEPLEPEPG | | RARMGVESYL | | PCPLLPSYHC |
PGVPSEASAG | | SGTPRATATS | | TTASPLRDGF | | GGQDGGELRP | | LQSEGAAALV |
TKGCQRLAAQ | | GARPEAPKRK | | WAEDGGDAPS | | PSKRPWARQE | | NQEAEREGGM |
SCSCSSGSGE | | ASAGLMEEAL | | PSAPERLALD | | YIVPCMRYYG | | ICVKDSFLGA |
ALGGRVLAEV | | EALKRGGRLR | | DGQLVSQRAI | | PPRSIRGDQI | | AWVEGHEPGC |
RSIGALMAHV | | DAVIRHCAGR | | LGSYVINGRT | | KAMVACYPGN | | GLGYVRHVDN |
PHGDGRCITC | | IYYLNQNWDV | | KVHGGLLQIF | | PEGRPVVANI | | EPLFDRLLIF |
WSDRRNPHEV | | KPAYATRYAI | | TVWYFDAKER | | AAAKDKYQLA | | SGQKGVQVPV |
SQPPTPT |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література
- Taylor M.S. (2001). Characterization and comparative analysis of the EGLN gene family. Gene. 275: 125—132. PMID 11574160 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00633-3
- Seth P., Krop I., Porter D., Polyak K. (2002). Novel estrogen and tamoxifen induced genes identified by SAGE (Serial Analysis of Gene Expression). Oncogene. 21: 836—843. PMID 11850811 DOI:10.1038/sj.onc.1205113
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Semenza G.L. (2001). HIF-1, O(2), and the 3 PHDs: how animal cells signal hypoxia to the nucleus. Cell. 107: 1—3. PMID 11595178 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00518-9
- Huang J., Zhao Q., Mooney S.M., Lee F.S. (2002). Sequence determinants in hypoxia-inducible factor-1alpha for hydroxylation by the prolyl hydroxylases PHD1, PHD2, and PHD3. J. Biol. Chem. 277: 39792—39800. PMID 12181324 DOI:10.1074/jbc.M206955200
- Tian Y.M., Mole D.R., Ratcliffe P.J., Gleadle J.M. (2006). Characterization of different isoforms of the HIF prolyl hydroxylase PHD1 generated by alternative initiation. Biochem. J. 397: 179—186. PMID 16509823 DOI:10.1042/BJ20051996
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14660 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96KS0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |