ELL3

Ідентифікатори

Символи

ELL3, ELL3 (gene), elongation factor for RNA polymerase II 3

Зовнішні ІД

OMIM: 609885 MGI: 2673679 HomoloGene: 11859 GeneCards: ELL3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ядерце • transcription elongation factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • positive regulation of neurogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • regulation of epithelial to mesenchymal transition • DNA-templated transcription, elongation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • stem cell differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of signal transduction by p53 class mediator • snRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80237


269344

Ensembl


ENSG00000128886


ENSMUSG00000027246

UniProt


Q9HB65


Q80VR2

RefSeq (мРНК)


NM_025165


NM_145973

RefSeq (білок)


NP_079441


NP_666085

Локус (UCSC)

Хр. 15: 43.77 – 43.78 Mb

Хр. 2: 121.27 – 121.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ELL3 (англ. Elongation factor for RNA polymerase II 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 45 361^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELQEPLRG	QLRLCFTQAA	RTSLLLLRLN	DAALRALQEC	QRQQVRPVIA
FQGHRGYLRL	PGPGWSCLFS	FIVSQCCQEG	AGGSLDLVCQ	RFLRSGPNSL
HCLGSLRERL	IIWAAMDSIP	APSSVQGHNL	TEDARHPESW	QNTGGYSEGD
AVSQPQMALE	EVSVSDPLAS	NQGQSLPGSS	REHMAQWEVR	SQTHVPNREP
VQALPSSASR	KRLDKKRSVP	VATVELEEKR	FRTLPLVPSP	LQGLTNQDLQ
EGEDWEQEDE	DMDPRLEHSS	SVQEDSESPS	PEDIPDYLLQ	YRAIHSAEQQ
HAYEQDFETD	YAEYRILHAR	VGTASQRFIE	LGAEIKRVRR	GTPEYKVLED
KIIQEYKKFR	KQYPSYREEK	RRCEYLHQKL	SHIKGLILEF	EEKNRGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Miller T., Williams K., Johnstone R.W., Shilatifard A. (2000). Identification, cloning, expression, and biochemical characterization of the testis-specific RNA polymerase II elongation factor ELL3. J. Biol. Chem. 275: 32052—32056. PMID 10882741 DOI:10.1074/jbc.M005175200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Luo Z., Lin C., Shilatifard A. (2012). The super elongation complex (SEC) family in transcriptional control. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 13: 543—547. PMID 22895430 DOI:10.1038/nrm3417

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23113 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HB65 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.