FHOD1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FHOD1, FHOS, formin homology 2 domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606881 HomoloGene: 40860 GeneCards: FHOD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein domain specific binding • protein self-association |
---|
Клітинна компонента | • cell projection • bleb • мембрана • клітинне ядро • цитоскелет • stress fiber • цитоплазма • гіалоплазма • intercalated disc |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of stress fiber assembly • nuclear migration • establishment of centrosome localization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of stress fiber assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ce/PBB_GE_FHOD1_218530_at_fs.png/250px-PBB_GE_FHOD1_218530_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001313484 NM_001313485 NM_001313486 NM_001313487 NM_001313488
| NM_001313489 NM_001313490 NM_059112 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 67.23 – 67.25 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FHOD1 (англ. Formin homology 2 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 164 амінокислот, а молекулярна маса — 126 551[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGGEDRGDG | | EPVSVVTVRV | | QYLEDTDPFA | | CANFPEPRRA | | PTCSLDGALP |
LGAQIPAVHR | | LLGAPLKLED | | CALQVSPSGY | | YLDTELSLEE | | QREMLEGFYE |
EISKGRKPTL | | ILRTQLSVRV | | NAILEKLYSS | | SGPELRRSLF | | SLKQIFQEDK |
DLVPEFVHSE | | GLSCLIRVGA | | AADHNYQSYI | | LRALGQLMLF | | VDGMLGVVAH |
SDTIQWLYTL | | CASLSRLVVK | | TALKLLLVFV | | EYSENNAPLF | | IRAVNSVAST |
TGAPPWANLV | | SILEEKNGAD | | PELLVYTVTL | | INKTLAALPD | | QDSFYDVTDA |
LEQQGMEALV | | QRHLGTAGTD | | VDLRTQLVLY | | ENALKLEDGD | | IEEAPGAGGR |
RERRKPSSEE | | GKRSRRSLEG | | GGCPARAPEP | | GPTGPASPVG | | PTSSTGPALL |
TGPASSPVGP | | PSGLQASVNL | | FPTISVAPSA | | DTSSERSIYK | | ARFLENVAAA |
ETEKQVALAQ | | GRAETLAGAM | | PNEAGGHPDA | | RQLWDSPETA | | PAARTPQSPA |
PCVLLRAQRS | | LAPEPKEPLI | | PASPKAEPIW | | ELPTRAPRLS | | IGDLDFSDLG |
EDEDQDMLNV | | ESVEAGKDIP | | APSPPLPLLS | | GVPPPPPLPP | | PPPIKGPFPP |
PPPLPLAAPL | | PHSVPDSSAL | | PTKRKTVKLF | | WRELKLAGGH | | GVSASRFGPC |
ATLWASLDPV | | SVDTARLEHL | | FESRAKEVLP | | SKKAGEGRRT | | MTTVLDPKRS |
NAINIGLTTL | | PPVHVIKAAL | | LNFDEFAVSK | | DGIEKLLTMM | | PTEEERQKIE |
EAQLANPDIP | | LGPAENFLMT | | LASIGGLAAR | | LQLWAFKLDY | | DSMEREIAEP |
LFDLKVGMEQ | | LVQNATFRCI | | LATLLAVGNF | | LNGSQSSGFE | | LSYLEKVSEV |
KDTVRRQSLL | | HHLCSLVLQT | | RPESSDLYSE | | IPALTRCAKV | | DFEQLTENLG |
QLERRSRAAE | | ESLRSLAKHE | | LAPALRARLT | | HFLDQCARRV | | AMLRIVHRRV |
CNRFHAFLLY | | LGYTPQAARE | | VRIMQFCHTL | | REFALEYRTC | | RERVLQQQQK |
QATYRERNKT | | RGRMITETEK | | FSGVAGEAPS | | NPSVPVAVSS | | GPGRGDADSH |
ASMKSLLTSR | | PEDTTHNRRS | | RGMVQSSSPI | | MPTVGPSTAS | | PEEPPGSSLP |
SDTSDEIMDL | | LVQSVTKSSP | | RALAARERKR | | SRGNRKSLRR | | TLKSGLGDDL |
VQALGLSKGP | | GLEV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.
Література
- Westendorf J.J., Mernaugh R., Hiebert S.W. (1999). Identification and characterization of a protein containing formin homology (FH1/FH2) domains. Gene. 232: 173—182. PMID 10352228 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00127-4
- Takeya R., Sumimoto H. (2003). Fhos, a mammalian formin, directly binds to F-actin via a region N-terminal to the FH1 domain and forms a homotypic complex via the FH2 domain to promote actin fiber formation. J. Cell Sci. 116: 4567—4575. PMID 14576350 DOI:10.1242/jcs.00769
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17905 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y613 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |