FKBP8 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b6/Protein_FKBP8_PDB_2awg.png/250px-Protein_FKBP8_PDB_2awg.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2AWG, 2D9F, 2F2D, 2MF9, 3EY6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FKBP8, FKBP38, FKBPr38, FK506 binding protein 8, FKBP prolyl isomerase 8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604840 MGI: 1341070 HomoloGene: 7720 GeneCards: FKBP8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • FK506 binding • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • disordered domain specific binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • мітохондріальна мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • мітохондріальна оболонка • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0097285 апоптоз • GO:0007243 intracellular signal transduction • multicellular organism growth • cell fate specification • negative regulation of apoptotic process • regulation of BMP signaling pathway • neural tube development • positive regulation of BMP signaling pathway • регуляція експресії генів • smoothened signaling pathway • camera-type eye development • dorsal/ventral neural tube patterning • GO:0022415 viral process • dorsal/ventral pattern formation • chaperone-mediated protein folding • protein peptidyl-prolyl isomerization • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c1/PBB_GE_FKBP8_208255_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_FKBP8_208255_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/19/PBB_GE_FKBP8_40850_at_fs.png/250px-PBB_GE_FKBP8_40850_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001111066 NM_001199631 NM_010223 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001295302 NP_036313 NP_001295302.1 |
| | NP_001104536 NP_001186560 NP_034353 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.53 – 18.54 Mb | Хр. 8: 70.98 – 70.99 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FKBP8 (англ. FK506 binding protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 44 562[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASCAEPSEP | | SAPLPAGVPP | | LEDFEVLDGV | | EDAEGEEEEE | | EEEEEEDDLS |
ELPPLEDMGQ | | PPAEEAEQPG | | ALAREFLAAM | | EPEPAPAPAP | | EEWLDILGNG |
LLRKKTLVPG | | PPGSSRPVKG | | QVVTVHLQTS | | LENGTRVQEE | | PELVFTLGDC |
DVIQALDLSV | | PLMDVGETAM | | VTADSKYCYG | | PQGRSPYIPP | | HAALCLEVTL |
KTAVDGPDLE | | MLTGQERVAL | | ANRKRECGNA | | HYQRADFVLA | | ANSYDLAIKA |
ITSSAKVDMT | | FEEEAQLLQL | | KVKCLNNLAA | | SQLKLDHYRA | | ALRSCSLVLE |
HQPDNIKALF | | RKGKVLAQQG | | EYSEAIPILR | | AALKLEPSNK | | TIHAELSKLV |
KKHAAQRSTE | | TALYRKMLGN | | PSRLPAKCPG | | KGAWSIPWKW | | LFGATAVALG |
GVALSVVIAA | | RN |
Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, мітохондрії.
Література
- Shirane M., Nakayama K.I. (2003). Inherent calcineurin inhibitor FKBP38 targets Bcl-2 to mitochondria and inhibits apoptosis. Nat. Cell Biol. 5: 28—37. PMID 12510191 DOI:10.1038/ncb894
- Bulgakov O.V., Eggenschwiler J.T., Hong D.-H., Anderson K.V., Li T. (2004). FKBP8 is a negative regulator of mouse sonic hedgehog signaling in neural tissues. Development. 131: 2149—2159. PMID 15105374 DOI:10.1242/dev.01122
- Chen Y., Sternberg P., Cai J. (2008). Characterization of a Bcl-XL-interacting protein FKBP8 and its splice variant in human RPE cells. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 49: 1721—1727. PMID 18385096 DOI:10.1167/iovs.07-1121
- Lam E., Martin M., Wiederrecht G. (1995). Isolation of a cDNA encoding a novel human FK506-binding protein homolog containing leucine zipper and tetratricopeptide repeat motifs. Gene. 160: 297—302. PMID 7543869 DOI:10.1016/0378-1119(95)00216-S
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kang C.B., Feng L., Chia J., Yoon H.S. (2005). Molecular characterization of FK-506 binding protein 38 and its potential regulatory role on the anti-apoptotic protein Bcl-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337: 30—38. PMID 16176796 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.09.023
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3724 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14318 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |