FKBP8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2AWG, 2D9F, 2F2D, 2MF9, 3EY6

Ідентифікатори

Символи

FKBP8, FKBP38, FKBPr38, FK506 binding protein 8, FKBP prolyl isomerase 8

Зовнішні ІД

OMIM: 604840 MGI: 1341070 HomoloGene: 7720 GeneCards: FKBP8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• FK506 binding • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • disordered domain specific binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • мітохондріальна мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • мітохондріальна оболонка • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз • GO:0007243 intracellular signal transduction • multicellular organism growth • cell fate specification • negative regulation of apoptotic process • regulation of BMP signaling pathway • neural tube development • positive regulation of BMP signaling pathway • регуляція експресії генів • smoothened signaling pathway • camera-type eye development • dorsal/ventral neural tube patterning • GO:0022415 viral process • dorsal/ventral pattern formation • chaperone-mediated protein folding • protein peptidyl-prolyl isomerization • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23770


14232

Ensembl


ENSG00000105701


ENSMUSG00000019428

UniProt


Q14318


O35465

RefSeq (мРНК)


NM_001308373 NM_012181


NM_001111066 NM_001199631 NM_010223

RefSeq (білок)


NP_001295302 NP_036313 NP_001295302.1


NP_001104536 NP_001186560 NP_034353

Локус (UCSC)

Хр. 19: 18.53 – 18.54 Mb

Хр. 8: 70.98 – 70.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FKBP8 (англ. FK506 binding protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 44 562^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASCAEPSEP	SAPLPAGVPP	LEDFEVLDGV	EDAEGEEEEE	EEEEEEDDLS
ELPPLEDMGQ	PPAEEAEQPG	ALAREFLAAM	EPEPAPAPAP	EEWLDILGNG
LLRKKTLVPG	PPGSSRPVKG	QVVTVHLQTS	LENGTRVQEE	PELVFTLGDC
DVIQALDLSV	PLMDVGETAM	VTADSKYCYG	PQGRSPYIPP	HAALCLEVTL
KTAVDGPDLE	MLTGQERVAL	ANRKRECGNA	HYQRADFVLA	ANSYDLAIKA
ITSSAKVDMT	FEEEAQLLQL	KVKCLNNLAA	SQLKLDHYRA	ALRSCSLVLE
HQPDNIKALF	RKGKVLAQQG	EYSEAIPILR	AALKLEPSNK	TIHAELSKLV
KKHAAQRSTE	TALYRKMLGN	PSRLPAKCPG	KGAWSIPWKW	LFGATAVALG
GVALSVVIAA	RN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, мітохондрії.

Література

Shirane M., Nakayama K.I. (2003). Inherent calcineurin inhibitor FKBP38 targets Bcl-2 to mitochondria and inhibits apoptosis. Nat. Cell Biol. 5: 28—37. PMID 12510191 DOI:10.1038/ncb894
Bulgakov O.V., Eggenschwiler J.T., Hong D.-H., Anderson K.V., Li T. (2004). FKBP8 is a negative regulator of mouse sonic hedgehog signaling in neural tissues. Development. 131: 2149—2159. PMID 15105374 DOI:10.1242/dev.01122
Chen Y., Sternberg P., Cai J. (2008). Characterization of a Bcl-XL-interacting protein FKBP8 and its splice variant in human RPE cells. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 49: 1721—1727. PMID 18385096 DOI:10.1167/iovs.07-1121
Lam E., Martin M., Wiederrecht G. (1995). Isolation of a cDNA encoding a novel human FK506-binding protein homolog containing leucine zipper and tetratricopeptide repeat motifs. Gene. 160: 297—302. PMID 7543869 DOI:10.1016/0378-1119(95)00216-S
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kang C.B., Feng L., Chia J., Yoon H.S. (2005). Molecular characterization of FK-506 binding protein 38 and its potential regulatory role on the anti-apoptotic protein Bcl-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337: 30—38. PMID 16176796 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.09.023

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3724 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14318 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.