FMNL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4YDH

Ідентифікатори

Символи

FMNL1, C17orf1, C17orf1B, FHOD4, FMNL, KW-13, formin like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604656 MGI: 1888994 HomoloGene: 136798 GeneCards: FMNL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• profilin binding • GTPase activating protein binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • cell cortex • phagocytic vesicle • bleb • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • integral component of membrane
Біологічний процес	• actin filament severing • substrate-dependent cell migration • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • cellular component organization • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • GO:0006928 клітинний процес
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


752


57778

Ensembl


ENSG00000184922


ENSMUSG00000055805

UniProt


O95466


Q9JL26

RefSeq (мРНК)


NM_005892


NM_001077698 NM_019679

RefSeq (білок)


NP_005883

NP_001071166 NP_062653 NP_001390541 NP_001390542 NP_001390543
NP_001390544 NP_001390545 NP_001390546 NP_001390547

Локус (UCSC)

Хр. 17: 45.22 – 45.25 Mb

Хр. 11: 103.06 – 103.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FMNL1 (англ. Formin like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 121 854^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNAAGSAEQ	PAGPAAPPPK	QPAPPKQPMP	AAGELEERFN	RALNCMNLPP
DKVQLLSQYD	NEKKWELICD	QERFQVKNPP	AAYIQKLKSY	VDTGGVSRKV
AADWMSNLGF	KRRVQESTQV	LRELETSLRT	NHIGWVQEFL	NEENRGLDVL
LEYLAFAQCS	VTYDMESTDN	GASNSEKNKP	LEQSVEDLSK	GPPSSVPKSR
HLTIKLTPAH	SRKALRNSRI	VSQKDDVHVC	IMCLRAIMNY	QSGFSLVMNH
PACVNEIALS	LNNKNPRTKA	LVLELLAAVC	LVRGGHDIIL	AAFDNFKEVC
GEQHRFEKLM	EYFRNEDSNI	DFMVACMQFI	NIVVHSVENM	NFRVFLQYEF
THLGLDLYLE	RLRLTESDKL	QVQIQAYLDN	IFDVGALLED	TETKNAVLEH
MEELQEQVAL	LTERLRDAEN	ESMAKIAELE	KQLSQARKEL	ETLRERFSES
TAMGPSRRPP	EPEKAPPAAP	TRPSALELKV	EELEEKGLIR	ILRGPGDAVS
IEILPVAVAT	PSGGDAPTPG	VPTGSPSPDL	APAAEPAPGA	APPPPPPLPG
LPSPQEAPPS	APPQAPPLPG	SPEPPPAPPL	PGDLPPPPPP	PPPPPGTDGP
VPPPPPPPPP	PPGGPPDALG	RRDSELGPGV	KAKKPIQTKF	RMPLLNWVAL
KPSQITGTVF	TELNDEKVLQ	ELDMSDFEEQ	FKTKSQGPSL	DLSALKSKAA
QKAPSKATLI	EANRAKNLAI	TLRKGNLGAE	RICQAIEAYD	LQALGLDFLE
LLMRFLPTEY	ERSLITRFER	EQRPMEELSE	EDRFMLCFSR	IPRLPERMTT
LTFLGNFPDT	AQLLMPQLNA	IIAASMSIKS	SDKLRQILEI	VLAFGNYMNS
SKRGAAYGFR	LQSLDALLEM	KSTDRKQTLL	HYLVKVIAEK	YPQLTGFHSD
LHFLDKAGSV	SLDSVLADVR	SLQRGLELTQ	REFVRQDDCM	VLKEFLRANS
PTMDKLLADS	KTAQEAFESV	VEYFGENPKT	TSPGLFFSLF	SRFIKAYKKA
EQEVEQWKKE	AAAQEAGADT	PGKGEPPAPK	SPPKARRPQM	DLISELKRRQ
QKEPLIYESD	RDGAIEDIIT	VIKTVPFTAR	TGKRTSRLLC	EASLGEEMPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Mason F.M., Heimsath E.G., Higgs H.N., Soderling S.H. (2011). Bi-modal regulation of a formin by srGAP2. J. Biol. Chem. 286: 6577—6586. PMID 21148482 DOI:10.1074/jbc.M110.190397

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1212 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O95466 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.