FXR2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3H8Z

Ідентифікатори

Символи

FXR2, FMR1L2, FXR2P, FMR1 autosomal homolog 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605339 MGI: 1346074 HomoloGene: 21014 GeneCards: FXR2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • protein homodimerization activity • identical protein binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • translation regulator activity
Клітинна компонента	• Полісома • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • аксон • ribonucleoprotein granule • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuronal cell body • dendritic spine
Біологічний процес	• negative regulation of translation • regulation of translation • regulation of mRNA stability • positive regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9513


23879

Ensembl


ENSG00000129245


ENSMUSG00000018765

UniProt


P51116


Q9WVR4 Q6P5B5

RefSeq (мРНК)


NM_004860


NM_011814

RefSeq (білок)


NP_004851


NP_035944

Локус (UCSC)

Хр. 17: 7.59 – 7.61 Mb

Хр. 11: 69.52 – 69.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FXR2 (англ. FMR1 autosomal homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 673 амінокислот, а молекулярна маса — 74 223^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGLASGGDV	EPGLPVEVRG	SNGAFYKGFV	KDVHEDSVTI	FFENNWQSER
QIPFGDVRLP	PPADYNKEIT	EGDEVEVYSR	ANEQEPCGWW	LARVRMMKGD
FYVIEYAACD	ATYNEIVTLE	RLRPVNPNPL	ATKGSFFKVT	MAVPEDLREA
CSNENVHKEF	KKALGANCIF	LNITNSELFI	LSTTEAPVKR	ASLLGDMHFR
SLRTKLLLMS	RNEEATKHLE	TSKQLAAAFQ	EEFTVREDLM	GLAIGTHGAN
IQQARKVPGV	TAIELGEETC	TFRIYGETPE	ACRQARSYLE	FSEDSVQVPR
NLVGKVIGKN	GKVIQEIVDK	SGVVRVRVEG	DNDKKNPREE	GMVPFIFVGT
RENISNAQAL	LEYHLSYLQE	VEQLRLERLQ	IDEQLRQIGL	GFRPPGSGRG
SGGSDKAGYS	TDESSSSSLH	ATRTYGGSYG	GRGRGRRTGG	PAYGPSSDVS
TASETESEKR	EEPNRAGPGD	RDPPTRGEES	RRRPTGGRGR	GPPPAPRPTS
RYNSSSISSV	LKDPDSNPYS	LLDTSEPEPP	VDSEPGEPPP	ASARRRRSRR
RRTDEDRTVM	DGGLESDGPN	MTENGLEDES	RPQRRNRSRR	RRNRGNRTDG
SISGDRQPVT	VADYISRAES	QSRQRPPLER	TKPSEDSLSG	QKGDSVSKLP
KGPSENGELS	APLELGSMVN	GVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Joseph D.R. (1998). The rat androgen-binding protein (ABP/SHBG) gene contains triplet repeats similar to unstable triplets: evidence that the ABP/SHBG and the fragile X-related 2 genes overlap. Steroids. 63: 2—4. PMID 9437788 DOI:10.1016/S0039-128X(97)00087-1
Siomi M.C., Zhang Y., Siomi H., Dreyfuss G. (1996). Specific sequences in the fragile X syndrome protein FMR1 and the FXR proteins mediate their binding to 60S ribosomal subunits and the interactions among them. Mol. Cell. Biol. 16: 3825—3832. PMID 8668200 DOI:10.1128/MCB.16.7.3825
Laggerbauer B., Ostareck D., Keidel E.M., Ostareck-Lederer A., Fischer U. (2001). Evidence that fragile X mental retardation protein is a negative regulator of translation. Hum. Mol. Genet. 10: 329—338. PMID 11157796 DOI:10.1093/hmg/10.4.329

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4024 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P51116 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.