GABARAPL2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4CO7

Ідентифікатори

Символи

GABARAPL2, ATG8, ATG8C, GATE-16, GATE16, GEF-2, GEF2, GABA type A receptor associated protein like 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607452 MGI: 1890602 HomoloGene: 68550 GeneCards: GABARAPL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GABA receptor binding • microtubule binding • ATPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • SNARE binding • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • внутрішньоклітинний • autophagosome • autophagosome membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of ATP-dependent activity • автофагія • protein transport • negative regulation of proteasomal protein catabolic process • intra-Golgi vesicle-mediated transport • macroautophagy • GO:0000046 autophagosome maturation • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • cellular response to nitrogen starvation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11345


93739

Ensembl


ENSG00000034713


ENSMUSG00000031950

UniProt


P60520


P60521

RefSeq (мРНК)


NM_007285


NM_026693

RefSeq (білок)


NP_009216


NP_080969

Локус (UCSC)

Хр. 16: 75.57 – 75.58 Mb

Хр. 8: 112.67 – 112.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GABARAPL2 (англ. GABA type A receptor associated protein like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 667^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKWMFKEDHS	LEHRCVESAK	IRAKYPDRVP	VIVEKVSGSQ	IVDIDKRKYL
VPSDITVAQF	MWIIRKRIQL	PSEKAIFLFV	DKTVPQSSLT	MGQLYEKEKD
EDGFLYVAYS	GENTFGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, апараті Ґольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2003). GATE-16 and GABARAP are authentic modifiers mediated by Apg7 and Apg3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 637—644. PMID 12507496 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02907-8
Behrends C., Sowa M.E., Gygi S.P., Harper J.W. (2010). Network organization of the human autophagy system. Nature. 466: 68—76. PMID 20562859 DOI:10.1038/nature09204
Itoh T., Kanno E., Uemura T., Waguri S., Fukuda M. (2011). OATL1, a novel autophagosome-resident Rab33B-GAP, regulates autophagosomal maturation. J. Cell Biol. 192: 839—853. PMID 21383079 DOI:10.1083/jcb.201008107

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13291 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P60520 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.