GABARAPL2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/56/Protein_GABARAPL2_PDB_1eo6.png/250px-Protein_GABARAPL2_PDB_1eo6.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GABARAPL2, ATG8, ATG8C, GATE-16, GATE16, GEF-2, GEF2, GABA type A receptor associated protein like 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607452 MGI: 1890602 HomoloGene: 68550 GeneCards: GABARAPL2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GABA receptor binding • microtubule binding • ATPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • SNARE binding • ubiquitin protein ligase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • внутрішньоклітинний • autophagosome • autophagosome membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of ATP-dependent activity • автофагія • protein transport • negative regulation of proteasomal protein catabolic process • intra-Golgi vesicle-mediated transport • macroautophagy • GO:0000046 autophagosome maturation • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • cellular response to nitrogen starvation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c8/PBB_GE_GABARAPL2_209046_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GABARAPL2_209046_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 75.57 – 75.58 Mb | Хр. 8: 112.67 – 112.68 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GABARAPL2 (англ. GABA type A receptor associated protein like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 117 амінокислот, а молекулярна маса — 13 667[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKWMFKEDHS | | LEHRCVESAK | | IRAKYPDRVP | | VIVEKVSGSQ | | IVDIDKRKYL |
VPSDITVAQF | | MWIIRKRIQL | | PSEKAIFLFV | | DKTVPQSSLT | | MGQLYEKEKD |
EDGFLYVAYS | | GENTFGF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, апараті Ґольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
- Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2003). GATE-16 and GABARAP are authentic modifiers mediated by Apg7 and Apg3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 637—644. PMID 12507496 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02907-8
- Behrends C., Sowa M.E., Gygi S.P., Harper J.W. (2010). Network organization of the human autophagy system. Nature. 466: 68—76. PMID 20562859 DOI:10.1038/nature09204
- Itoh T., Kanno E., Uemura T., Waguri S., Fukuda M. (2011). OATL1, a novel autophagosome-resident Rab33B-GAP, regulates autophagosomal maturation. J. Cell Biol. 192: 839—853. PMID 21383079 DOI:10.1083/jcb.201008107
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13291 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P60520 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |