GABPB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AWC

Ідентифікатори

Символи

GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, GA binding protein transcription factor beta subunit 1, GA binding protein transcription factor subunit beta 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600610 MGI: 95611 HomoloGene: 7723 GeneCards: GABPB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein heterodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mitochondrion organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2553


14391

Ensembl


ENSG00000104064


ENSMUSG00000027361

UniProt


Q06547


Q00420

RefSeq (мРНК)

NM_002041 NM_005254 NM_016654 NM_016655 NM_181427
NM_001320910 NM_001320915

NM_001271467 NM_001271468 NM_001271469 NM_001271470 NM_001271492
NM_010249 NM_207669 NM_001355108 NM_001355109

RefSeq (білок)

NP_001307839 NP_001307844 NP_002032 NP_005245 NP_057738
NP_057739 NP_852092 NP_057738.1

NP_001258396
NP_001258397
NP_001258398
NP_001258399
NP_001258421

NP_034379
NP_997552
NP_001342037
NP_001342038
NP_001393121
NP_001393122
NP_001393123
NP_001393124
NP_001393125
NP_001393126
NP_001393127
NP_001393128
NP_001393129
NP_001393130
NP_001393131
NP_001393132
NP_001393133
NP_001393134
NP_001393135
NP_001393136
NP_001393137
NP_001393138
NP_001393139
NP_001393140
NP_001393141
NP_001393142
NP_001393143
NP_001393144
NP_001393145
NP_001393146
NP_001393147
NP_001393148
NP_001393149
NP_001393150
NP_001393151
NP_001393152
NP_001393153
NP_001393154
NP_001393155
NP_001393156

Локус (UCSC)

Хр. 15: 50.28 – 50.36 Mb

Хр. 2: 126.47 – 126.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GABPB1 (англ. GA binding protein transcription factor beta subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 42 483^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLVDLGKKL	LEAARAGQDD	EVRILMANGA	PFTTDWLGTS	PLHLAAQYGH
YSTTEVLLRA	GVSRDARTKV	DRTPLHMAAS	EGHASIVEVL	LKHGADVNAK
DMLKMTALHW	ATEHNHQEVV	ELLIKYGADV	HTQSKFCKTA	FDISIDNGNE
DLAEILQIAM	QNQINTNPES	PDTVTIHAAT	PQFIIGPGGV	VNLTGLVSSE
NSSKATDETG	VSAVQFGNSS	TSVLATLAAL	AEASAPLSNS	SETPVVATEE
VVTAESVDGA	IQQVVSSGGQ	QVITIVTDGI	QLGNLHSIPT	SGIGQPIIVT
MPDGQQVLTV	PATDIAEETV	ISEEPPAKRQ	CIEIIENRVE	SAEIEEREAL
QKQLDEANRE	AQKYRQQLLK	KEQEAEAYRQ	KLEAMTRLQT	NKEAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain. Mol. Cell. Biol. 15: 102—111. PMID 7799916 DOI:10.1128/MCB.15.1.102
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Virbasius J.V., Virbasius C.A., Scarpulla R.C. (1993). Identity of GABP with NRF-2, a multisubunit activator of cytochrome oxidase expression, reveals a cellular role for an ETS domain activator of viral promoters. Genes Dev. 7: 380—392. PMID 8383622 DOI:10.1101/gad.7.3.380
Gugneja S., Virbasius C.M., Scarpulla R.C. (1996). Nuclear respiratory factors 1 and 2 utilize similar glutamine-containing clusters of hydrophobic residues to activate transcription. Mol. Cell. Biol. 16: 5708—5716. PMID 8816484 DOI:10.1128/MCB.16.10.5708
Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP. EMBO J. 19: 683—690. PMID 10675337 DOI:10.1093/emboj/19.4.683

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4074 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q06547 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.