GLI1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a7/Protein_GLI1_PDB_2gli.png/250px-Protein_GLI1_PDB_2gli.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2GLI, 4BLB, 4KMD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GLI1, GLI, GLI family zinc finger 1, PAPA8, PPD1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 GeneCards: GLI1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • microtubule binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • війка • нуклеоплазма • ciliary base • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • epidermal cell differentiation • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • positive regulation of cell migration • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation • notochord regression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA replication • ventral midline development • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • liver regeneration • response to wounding • regulation of osteoblast differentiation • osteoblast differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell population proliferation • cerebellar cortex morphogenesis • regulation of hepatocyte proliferation • canonical Wnt signaling pathway • smoothened signaling pathway • dorsal/ventral pattern formation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • prostate gland development • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b8/PBB_GE_GLI1_206646_at_fs.png/250px-PBB_GE_GLI1_206646_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001160045 NM_001167609 NM_005269 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001153517 NP_001161081 NP_005260 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 57.46 – 57.47 Mb | Хр. 10: 127.17 – 127.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GLI1 (англ. GLI family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 117 904[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFNSMTPPPI | | SSYGEPCCLR | | PLPSQGAPSV | | GTEGLSGPPF | | CHQANLMSGP |
HSYGPARETN | | SCTEGPLFSS | | PRSAVKLTKK | | RALSISPLSD | | ASLDLQTVIR |
TSPSSLVAFI | | NSRCTSPGGS | | YGHLSIGTMS | | PSLGFPAQMN | | HQKGPSPSFG |
VQPCGPHDSA | | RGGMIPHPQS | | RGPFPTCQLK | | SELDMLVGKC | | REEPLEGDMS |
SPNSTGIQDP | | LLGMLDGRED | | LEREEKREPE | | SVYETDCRWD | | GCSQEFDSQE |
QLVHHINSEH | | IHGERKEFVC | | HWGGCSRELR | | PFKAQYMLVV | | HMRRHTGEKP |
HKCTFEGCRK | | SYSRLENLKT | | HLRSHTGEKP | | YMCEHEGCSK | | AFSNASDRAK |
HQNRTHSNEK | | PYVCKLPGCT | | KRYTDPSSLR | | KHVKTVHGPD | | AHVTKRHRGD |
GPLPRAPSIS | | TVEPKREREG | | GPIREESRLT | | VPEGAMKPQP | | SPGAQSSCSS |
DHSPAGSAAN | | TDSGVEMTGN | | AGGSTEDLSS | | LDEGPCIAGT | | GLSTLRRLEN |
LRLDQLHQLR | | PIGTRGLKLP | | SLSHTGTTVS | | RRVGPPVSLE | | RRSSSSSSIS |
SAYTVSRRSS | | LASPFPPGSP | | PENGASSLPG | | LMPAQHYLLR | | ARYASARGGG |
TSPTAASSLD | | RIGGLPMPPW | | RSRAEYPGYN | | PNAGVTRRAS | | DPAQAADRPA |
PARVQRFKSL | | GCVHTPPTVA | | GGGQNFDPYL | | PTSVYSPQPP | | SITENAAMDA |
RGLQEEPEVG | | TSMVGSGLNP | | YMDFPPTDTL | | GYGGPEGAAA | | EPYGARGPGS |
LPLGPGPPTN | | YGPNPCPQQA | | SYPDPTQETW | | GEFPSHSGLY | | PGPKALGGTY |
SQCPRLEHYG | | QVQVKPEQGC | | PVGSDSTGLA | | PCLNAHPSEG | | PPHPQPLFSH |
YPQPSPPQYL | | QSGPYTQPPP | | DYLPSEPRPC | | LDFDSPTHST | | GQLKAQLVCN |
YVQSQQELLW | | EGGGREDAPA | | QEPSYQSPKF | | LGGSQVSPSR | | AKAPVNTYGP |
GFGPNLPNHK | | SGSYPTPSPC | | HENFVVGANR | | ASHRAAAPPR | | LLPPLPTCYG |
PLKVGGTNPS | | CGHPEVGRLG | | GGPALYPPPE | | GQVCNPLDSL | | DLDNTQLDFV |
AILDEPQGLS | | PPPSHDQRGS | | SGHTPPPSGP | | PNMAVGNMSV | | LLRSLPGETE |
FLNSSA |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Kinzler K.W., Ruppert J.M., Bigner S.H., Vogelstein B. (1988). The GLI gene is a member of the Kruppel family of zinc finger proteins. Nature. 332: 371—374. PMID 2832761 DOI:10.1038/332371a0
- Lo H.W., Zhu H., Cao X., Aldrich A., Ali-Osman F. (2009). A novel splice variant of GLI1 that promotes glioblastoma cell migration and invasion. Cancer Res. 69: 6790—6798. PMID 19706761 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-09-0886
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kinzler K.W., Vogelstein B. (1990). The GLI gene encodes a nuclear protein which binds specific sequences in the human genome. Mol. Cell. Biol. 10: 634—642. PMID 2105456 DOI:10.1128/MCB.10.2.634
- Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins. J. Biol. Chem. 276: 6889—6892. PMID 11238441 DOI:10.1074/jbc.C000773200
- Maloverjan A., Piirsoo M., Michelson P., Kogerman P., Osterlund T. (2010). Identification of a novel serine/threonine kinase ULK3 as a positive regulator of Hedgehog pathway. Exp. Cell Res. 316: 627—637. PMID 19878745 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.018
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4317 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P08151 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |