GPATCH8

Ідентифікатори

Символи

GPATCH8, GPATC8, KIAA0553, G-patch domain containing 8

Зовнішні ІД

OMIM: 614396 MGI: 1918667 HomoloGene: 46117 GeneCards: GPATCH8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• компонент клітини
Біологічний процес	• GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23131


237943

Ensembl


ENSG00000186566


ENSMUSG00000034621

UniProt


Q9UKJ3


A2A6A1

RefSeq (мРНК)

NM_001002909 NM_001304939 NM_001304940 NM_001304941 NM_001304942
NM_001304943


NM_001159492

RefSeq (білок)

NP_001002909 NP_001291868 NP_001291869 NP_001291870 NP_001291871
NP_001291872


NP_001152964

Локус (UCSC)

Хр. 17: 44.4 – 44.5 Mb

Хр. 11: 102.48 – 102.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GPATCH8 (англ. G-patch domain containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 502 амінокислот, а молекулярна маса — 164 197^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADRFSRFNE	DRDFQGNHFD	QYEEGHLEIE	QASLDKPIES	DNIGHRLLQK
HGWKLGQGLG	KSLQGRTDPI	PIVVKYDVMG	MGRMEMELDY	AEDATERRRV
LEVEKEDTEE	LRQKYKDYVD	KEKAIAKALE	DLRANFYCEL	CDKQYQKHQE
FDNHINSYDH	AHKQRLKDLK	QREFARNVSS	RSRKDEKKQE	KALRRLHELA
EQRKQAECAP	GSGPMFKPTT	VAVDEEGGED	DKDESATNSG	TGATASCGLG
SEFSTDKGGP	FTAVQITNTT	GLAQAPGLAS	QGISFGIKNN	LGTPLQKLGV
SFSFAKKAPV	KLESIASVFK	DHAEEGTSED	GTKPDEKSSD	QGLQKVGDSD
GSSNLDGKKE	DEDPQDGGSL	ASTLSKLKRM	KREEGAGATE	PEYYHYIPPA
HCKVKPNFPF	LLFMRASEQM	DGDNTTHPKN	APESKKGSSP	KPKSCIKAAA
SQGAEKTVSE	VSEQPKETSM	TEPSEPGSKA	EAKKALGGDV	SDQSLESHSQ
KVSETQMCES	NSSKETSLAT	PAGKESQEGP	KHPTGPFFPV	LSKDESTALQ
WPSELLIFTK	AEPSISYSCN	PLYFDFKLSR	NKDARTKGTE	KPKDIGSSSK
DHLQGLDPGE	PNKSKEVGGE	KIVRSSGGRM	DAPASGSACS	GLNKQEPGGS
HGSETEDTGR	SLPSKKERSG	KSHRHKKKKK	HKKSSKHKRK	HKADTEEKSS
KAESGEKSKK	RKKRKRKKNK	SSAPADSERG	PKPEPPGSGS	PAPPRRRRRA
QDDSQRRSLP	AEEGSSGKKD	EGGGGSSSQD	HGGRKHKGEL	PPSSCQRRAG
TKRSSRSSHR	SQPSSGDEDS	DDASSHRLHQ	KSPSQYSEEE	EEEDSGSEHS
RSRSRSGRRH	SSHRSSRRSY	SSSSDASSDQ	SCYSRQRSYS	DDSYSDYSDR
SRRHSKRSHD	SDDSDYASSK	HRSKRHKYSS	SDDDYSLSCS	QSRSRSRSHT
RERSRSRGRS	RSSSCSRSRS	KRRSRSTTAH	SWQRSRSYSR	DRSRSTRSPS
QRSGSRKRSW	GHESPEERHS	GRRDFIRSKI	YRSQSPHYFR	SGRGEGPGKK
DDGRGDDSKA	TGPPSQNSNI	GTGRGSEGDC	SPEDKNSVTA	KLLLEKIQSR
KVERKPSVSE	EVQATPNKAG	PKLKDPPQGY	FGPKLPPSLG	NKPVLPLIGK
LPATRKPNKK	CEESGLERGE	EQEQSETEEG	PPGSSDALFG	HQFPSEETTG
PLLDPPPEES	KSGEATADHP	VAPLGTPAHS	DCYPGDPTIS	HNYLPDPSDG
DTLESLDSSS	QPGPVESSLL	PIAPDLEHFP	SYAPPSGDPS	IESTDGAEDA
SLAPLESQPI	TFTPEEMEKY	SKLQQAAQQH	IQQQLLAKQV	KAFPASAALA
PATPALQPIH	IQQPATASAT	SITTVQHAIL	QHHAAAAAAA	IGIHPHPHPQ
PLAQVHHIPQ	PHLTPISLSH	LTHSIIPGHP	ATFLASHPIH	IIPASAIHPG
PFTFHPVPHA	ALYPTLLAPR	PAAAAATALH	LHPLLHPIFS	GQDLQHPPSH
GT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29066 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UKJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.