GPS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4D10, 4D18, 4WSN

Ідентифікатори

Символи

GPS1, COPS1, CSN1, SGN1, G protein pathway suppressor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601934 MGI: 2384801 HomoloGene: 3046 GeneCards: GPS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTPase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • COP9 signalosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• JNK cascade • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2873


209318

Ensembl


ENSG00000169727


ENSMUSG00000025156

UniProt


Q13098


Q99LD4

RefSeq (мРНК)

NM_004127 NM_212492 NM_001321089 NM_001321090 NM_001321091
NM_001321092 NM_001321093 NM_001330539 NM_001330541


NM_001177874 NM_145370 NM_001346709 NM_001363440

RefSeq (білок)

NP_001308018 NP_001308019 NP_001308020 NP_001308021 NP_001308022
NP_001317468 NP_001317470 NP_004118 NP_997657


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 82.05 – 82.06 Mb

Хр. 11: 120.68 – 120.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GPS1 (англ. G protein pathway suppressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 55 537^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLPVQVFNL	QGAVEPMQID	VDPQEDPQNA	PDVNYVVENP	SLDLEQYAAS
YSGLMRIERL	QFIADHCPTL	RVEALKMALS	FVQRTFNVDM	YEEIHRKLSE
ATRSSLRELQ	NAPDAIPESG	VEPPALDTAW	VEATRKKALL	KLEKLDTDLK
NYKGNSIKES	IRRGHDDLGD	HYLDCGDLSN	ALKCYSRARD	YCTSAKHVIN
MCLNVIKVSV	YLQNWSHVLS	YVSKAESTPE	IAEQRGERDS	QTQAILTKLK
CAAGLAELAA	RKYKQAAKCL	LLASFDHCDF	PELLSPSNVA	IYGGLCALAT
FDRQELQRNV	ISSSSFKLFL	ELEPQVRDII	FKFYESKYAS	CLKMLDEMKD
NLLLDMYLAP	HVRTLYTQIR	NRALIQYFSP	YVSADMHRMA	AAFNTTVAAL
EDELTQLILE	GLISARVDSH	SKILYARDVD	QRSTTFEKSL	LMGKEFQRRA
KAMMLRAAVL	RNQIHVKSPP	REGSQGELTP	ANSQSRMSTN	M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tsuge T., Matsui M., Wei N. (2001). The subunit 1 of the COP9 signalosome suppresses gene expression through its N-terminal domain and incorporates into the complex through the PCI domain. J. Mol. Biol. 305: 1—9. PMID 11114242 DOI:10.1006/jmbi.2000.4288
Sun Y., Wilson M.P., Majerus P.W. (2002). Inositol 1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase associates with the COP9 signalosome by binding to CSN1. J. Biol. Chem. 277: 45759—45764. PMID 12324474 DOI:10.1074/jbc.M208709200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4549 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13098 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.