GSDMA : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

GSDMA

Ідентифікатори

Символи

GSDMA, GSDM, GSDM1, FKSG9, gasdermin A

Зовнішні ІД

OMIM: 611218 MGI: 1889509 HomoloGene: 10962 GeneCards: GSDMA

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylserine binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • GO:0097285 апоптоз • Піроптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


284110


57911

Ensembl


ENSG00000167914


ENSMUSG00000017204

UniProt


Q96QA5


Q9EST1

RefSeq (мРНК)


NM_178171


NM_021347

RefSeq (білок)


NP_835465


NP_067322

Локус (UCSC)

Хр. 17: 39.95 – 39.98 Mb

Хр. 11: 98.56 – 98.57 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GSDMA (англ. Gasdermin A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 49 365^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTMFENVTRA	LARQLNPRGD	LTPLDSLIDF	KRFHPFCLVL	RKRKSTLFWG
ARYVRTDYTL	LDVLEPGSSP	SDPTDTGNFG	FKNMLDTRVE	GDVDVPKTVK
VKGTAGLSQN	STLEVQTLSV	APKALETVQE	RKLAADHPFL	KEMQDQGENL
YVVMEVVETV	QEVTLERAGK	AEACFSLPFF	APLGLQGSIN	HKEAVTIPKG
CVLAFRVRQL	MVKGKDEWDI	PHICNDNMQT	FPPGEKSGEE	KVILIQASDV
GDVHEGFRTL	KEEVQRETQQ	VEKLSRVGQS	SLLSSLSKLL	GKKKELQDLE
LALEGALDKG	HEVTLEALPK	DVLLSKEAVG	AILYFVGALT	ELSEAQQKLL
VKSMEKKILP	VQLKLVESTM	EQNFLLDKEG	VFPLQPELLS	SLGDEELTLT
EALVGLSGLE	VQRSGPQYMW	DPDTLPRLCA	LYAGLSLLQQ	LTKAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Saeki N., Kuwahara Y., Sasaki H., Satoh H., Shiroishi T. (2000). Gasdermin (Gsdm) localizing to mouse chromosome 11 is predominantly expressed in upper gastrointestinal tract but significantly suppressed in human gastric cancer cells. Mamm. Genome. 11: 718—724. PMID 10967128 DOI:10.1007/s003350010138

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GSDMA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13311 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96QA5 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.