GTF3C2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GTF3C2, TFIIIC-BETA, TFIIIC110, general transcription factor IIIC subunit 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604883 MGI: 1919002 HomoloGene: 37490 GeneCards: GTF3C2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity |
---|
Клітинна компонента | • transcription factor TFIIIC complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • tRNA transcription by RNA polymerase III • 5S class rRNA transcription by RNA polymerase III • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6b/PBB_GE_GTF3C2_204366_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GTF3C2_204366_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/81/PBB_GE_GTF3C2_212429_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GTF3C2_212429_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/21/PBB_GE_GTF3C2_210620_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GTF3C2_210620_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001035521 NM_001521 NM_001318909 NM_001388380 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001030598 NP_001305838 NP_001512 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 27.33 – 27.36 Mb | Хр. 5: 31.31 – 31.34 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GTF3C2 (англ. General transcription factor IIIC subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 100 680[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDTCGVGYVA | | LGEAGPVGNM | | TVVDSPGQEV | | LNQLDVKTSS | | EMTSAEASVE |
MSLPTPLPGF | | EDSPDQRRLP | | PEQESLSRLE | | QPDLSSEMSK | | VSKPRASKPG |
RKRGGRTRKG | | PKRPQQPNPP | | SAPLVPGLLD | | QSNPLSTPMP | | KKRGRKSKAE |
LLLLKLSKDL | | DRPESQSPKR | | PPEDFETPSG | | ERPRRRAAQV | | ALLYLQELAE |
ELSTALPAPV | | SCPEGPKVSS | | PTKPKKIRQP | | AACPGGEEVD | | GAPRDEDFFL |
QVEAEDVEES | | EGPSESSSEP | | EPVVPRSTPR | | GSTSGKQKPH | | CRGMAPNGLP |
NHIMAPVWKC | | LHLTKDFREQ | | KHSYWEFAEW | | IPLAWKWHLL | | SELEAAPYLP |
QEEKSPLFSV | | QREGLPEDGT | | LYRINRFSSI | | TAHPERWDVS | | FFTGGPLWAL |
DWCPVPEGAG | | ASQYVALFSS | | PDMNETHPLS | | QLHSGPGLLQ | | LWGLGTLQQE |
SCPGNRAHFV | | YGIACDNGCI | | WDLKFCPSGA | | WELPGTPRKA | | PLLPRLGLLA |
LACSDGKVLL | | FSLPHPEALL | | AQQPPDAVKP | | AIYKVQCVAT | | LQVGSMQATD |
PSECGQCLSL | | AWMPTRPHQH | | LAAGYYNGMV | | VFWNLPTNSP | | LQRIRLSDGS |
LKLYPFQCFL | | AHDQAVRTLQ | | WCKANSHFLV | | SAGSDRKIKF | | WDLRRPYEPI |
NSIKRFLSTE | | LAWLLPYNGV | | TVAQDNCYAS | | YGLCGIHYID | | AGYLGFKAYF |
TAPRKGTVWS | | LSGSDWLGTI | | AAGDISGELI | | AAILPDMALN | | PINVKRPVER |
RFPIYKADLI | | PYQDSPEGPD | | HSSASSGVPN | | PPKARTYTET | | VNHHYLLFQD |
TDLGSFHDLL | | RREPMLRMQE | | GEGHSQLCLD | | RLQLEAIHKV | | RFSPNLDSYG |
WLVSGGQSGL | | VRIHFVRGLA | | SPLGHRMQLE | | SRAHFNAMFQ | | PSSPTRRPGF |
SPTSHRLLPT | | P |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Sinn E., Wang Z., Kovelman R., Roeder R.G. (1995). Cloning and characterization of a TFIIIC2 subunit (TFIIIC beta) whose presence correlates with activation of RNA polymerase III-mediated transcription by adenovirus E1A expression and serum factors. Genes Dev. 9: 675—685. PMID 7729686 DOI:10.1101/gad.9.6.675
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4665 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WUA4 (англ.) . Архів оригіналу за 14 червня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|