HEXIM1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2GD7, 3S9G | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HEXIM1, CLP1, EDG1, HIS1, MAQ1, hexamethylene bis-acetamide inducible 1, hexamethylene bisacetamide inducible 1, HEXIM P-TEFb complex subunit 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607328 MGI: 2385923 HomoloGene: 31382 GeneCards: HEXIM1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snRNA binding • 7SK snRNA binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of signal transduction by p53 class mediator • heart development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ee/PBB_GE_HEXIM1_202814_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HEXIM1_202814_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a7/PBB_GE_HEXIM1_202815_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HEXIM1_202815_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 45.15 – 45.15 Mb | Хр. 11: 103.01 – 103.01 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HEXIM1 (англ. Hexamethylene bisacetamide inducible 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 623[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAEPFLSEYQ | | HQPQTSNCTG | | AAAVQEELNP | | ERPPGAEERV | | PEEDSRWQSR |
AFPQLGGRPG | | PEGEGSLESQ | | PPPLQTQACP | | ESSCLREGEK | | GQNGDDSSAG |
GDFPPPAEVE | | PTPEAELLAQ | | PCHDSEASKL | | GAPAAGGEEE | | WGQQQRQLGK |
KKHRRRPSKK | | KRHWKPYYKL | | TWEEKKKFDE | | KQSLRASRIR | | AEMFAKGQPV |
APYNTTQFLM | | DDHDQEEPDL | | KTGLYSKRAA | | AKSDDTSDDD | | FMEEGGEEDG |
GSDGMGGDGS | | EFLQRDFSET | | YERYHTESLQ | | NMSKQELIKE | | YLELEKCLSR |
MEDENNRLRL | | ESKRLGGDDA | | RVRELELELD | | RLRAENLQLL | | TENELHRQQE |
RAPLSKFGD |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yik J.H.N., Chen R., Pezda A.C., Samford C.S., Zhou Q. (2004). A human immunodeficiency virus type 1 Tat-like arginine-rich RNA-binding domain is essential for HEXIM1 to inhibit RNA polymerase II transcription through 7SK snRNA-mediated inactivation of P-TEFb. Mol. Cell. Biol. 24: 5094—5105. PMID 15169877 DOI:10.1128/MCB.24.12.5094-5105.2004
- Yik J.H.N., Chen R., Pezda A.C., Zhou Q. (2005). Compensatory contributions of HEXIM1 and HEXIM2 in maintaining the balance of active and inactive positive transcription elongation factor b complexes for control of transcription. J. Biol. Chem. 280: 16368—16376. PMID 15713661 DOI:10.1074/jbc.M500912200
- Blazek D., Barboric M., Kohoutek J., Oven I., Peterlin B.M. (2005). Oligomerization of HEXIM1 via 7SK snRNA and coiled-coil region directs the inhibition of P-TEFb. Nucleic Acids Res. 33: 7000—7010. PMID 16377779 DOI:10.1093/nar/gki997
- Wittmann B.M., Fujinaga K., Deng H., Ogba N., Montano M.M. (2005). The breast cell growth inhibitor, estrogen down regulated gene 1, modulates a novel functional interaction between estrogen receptor alpha and transcriptional elongation factor cyclin T1. Oncogene. 24: 5576—5588. PMID 15940264 DOI:10.1038/sj.onc.1208728
- Kohoutek J., Blazek D., Peterlin B.M. (2006). Hexim1 sequesters positive transcription elongation factor b from the class II transactivator on MHC class II promoters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 17349—17354. PMID 17088550 DOI:10.1073/pnas.0603079103
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24953 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O94992 (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |