HHEX

HHEX
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2E1O

Ідентифікатори
Символи HHEX, HEX, HMPH, HOX11L-PEN, PRH, PRHX, hematopoietically expressed homeobox
Зовнішні ІД OMIM: 604420 MGI: 96086 HomoloGene: 31110 GeneCards: HHEX
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
protein homodimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
HMG box domain binding
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
eukaryotic initiation factor 4E binding
TBP-class protein binding
DNA binding, bending
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
protein-DNA complex
клітинне ядро

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
myeloid leukocyte differentiation
endoderm development
DNA conformation change
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
primary lung bud formation
negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
multicellular organism growth
embryonic organ development
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
interkinetic nuclear migration
negative regulation of transcription by competitive promoter binding
hepatocyte differentiation
in utero embryonic development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Wnt signaling pathway
tissue morphogenesis
mRNA export from nucleus
transcription, DNA-templated
embryonic heart tube development
васкулогенез
morphogenesis of an epithelium
poly(A)+ mRNA export from nucleus
positive regulation of Wnt signaling pathway
forebrain morphogenesis
multicellular organism development
hepatoblast differentiation
thyroid gland development
common bile duct development
regulation of cell population proliferation
protein localization to nucleus
gall bladder development
negative regulation of angiogenesis
pancreas development
animal organ morphogenesis
B cell differentiation
hepatic duct development
liver development
negative regulation of transcription by transcription factor localization
forebrain development
проліферація
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
primitive streak formation
anterior/posterior pattern specification
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0072468 сигнальна трансдукція
response to peptide hormone
response to wounding
диференціація клітин
кровотворення
regulation of leukocyte proliferation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3087
15242
Ensembl
ENSG00000152804
ENSMUSG00000024986
UniProt
Q03014
P43120
RefSeq (мРНК)
NM_002729
NM_008245
RefSeq (білок)
NP_002720
NP_032271
Локус (UCSC) Хр. 10: 92.69 – 92.7 Mb Хр. 19: 37.42 – 37.43 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HHEX (англ. Hematopoietically expressed homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 022[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQYPHPGPAAGAVGVPLYAPTPLLQPAHPTPFYIEDILGRGPAAPTPAPT
LPSPNSSFTSLVSPYRTPVYEPTPIHPAFSHHSAAALAAAYGPGGFGGPL
YPFPRTVNDYTHALLRHDPLGKPLLWSPFLQRPLHKRKGGQVRFSNDQTI
ELEKKFETQKYLSPPERKRLAKMLQLSERQVKTWFQNRRAKWRRLKQENP
QSNKKEELESLDSSCDQRQDLPSEQNKGASLDSSQCSPSPASQEDLESEI
SEDSDQEVDIEGDKSYFNAG

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Hromas R.A., Collins S.J., Radich J. (1993). PCR cloning of an orphan homeobox gene (PRH) preferentially expressed in myeloid and liver cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 195: 976—983. PMID 8103988 DOI:10.1006/bbrc.1993.2140
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bedford F.K., Ashworth A., Enver T., Wiedemann L.M. (1993). HEX: a novel homeobox gene expressed during haematopoiesis and conserved between mouse and human. Nucleic Acids Res. 21: 1245—1249. PMID 8096636 DOI:10.1093/nar/21.5.1245
  • Neidle S., Goodwin G.H. (1994). A homology-based molecular model of the proline-rich homeodomain protein Prh, from haematopoietic cells. FEBS Lett. 345: 93—98. PMID 7911091 DOI:10.1016/0014-5793(94)00446-3

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4901 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q03014 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 10
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші