HKR1

Ідентифікатори

Символи

ZNF875, HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, zinc finger protein 875, HKR1

Зовнішні ІД

OMIM: 165250 HomoloGene: 65609 GeneCards: ZNF875

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


284459


н/д

Ensembl


ENSG00000181666


н/д

UniProt


P10072


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001329761 NM_001329762 NM_001329763 NM_001329764 NM_001329765
NM_001329766 NM_001329767 NM_001329768 NM_001329769 NM_001329770 NM_001329771 NM_001329772 NM_001329773 NM_001329774 NM_001329775 NM_001329776 NM_001329777 NM_001329778 NM_001329779 NM_181786 NM_001353803 NM_001353804


н/д

RefSeq (білок)

NP_001316690 NP_001316691 NP_001316692 NP_001316693 NP_001316694
NP_001316695 NP_001316696 NP_001316697 NP_001316698 NP_001316699 NP_001316700 NP_001316701 NP_001316702 NP_001316703 NP_001316704 NP_001316705 NP_001316706 NP_001316707 NP_001316708 NP_861451 NP_001340732 NP_001340733


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 37.31 – 37.37 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

HKR1 (англ. HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 659 амінокислот, а молекулярна маса — 75 128^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVNHTVSTM	LPTCMVHRQT	MSCSGAGGIT	AFVAFRDVAV	YFTQEEWRLL
SPAQRTLHRE	VMLETYNHLV	SLEIPSSKPK	LIAQLERGEA	PWREERKCPL
DLCPESKPEI	QLSPSCPLIF	SSQQALSQHV	WLSHLSQLFS	SLWAGNPLHL
GKHYPEDQKQ	QQDPFCFSGK	AEWIQEGEDS	RLLFGRVSKN	GTSKALSSPP
EEQQPAQSKE	DNTVVDIGSS	PERRADLEET	DKVLHGLEVS	GFGEIKYEEF
GPGFIKESNL	LSLQKTQTGE	TPYMYTEWGD	SFGSMSVLIK	NPRTHSGGKP
YVCRECGRGF	TWKSNLITHQ	RTHSGEKPYV	CKDCGRGFTW	KSNLFTHQRT
HSGLKPYVCK	ECGQSFSLKS	NLITHQRAHT	GEKPYVCREC	GRGFRQHSHL
VRHKRTHSGE	KPYICRECEQ	GFSQKSHLIR	HLRTHTGEKP	YVCTECGRHF
SWKSNLKTHQ	RTHSGVKPYV	CLECGQCFSL	KSNLNKHQRS	HTGEKPFVCT
ECGRGFTRKS	TLSTHQRTHS	GEKPFVCAEC	GRGFNDKSTL	ISHQRTHSGE
KPFMCRECGR	RFRQKPNLFR	HKRAHSGAFV	CRECGQGFCA	KLTLIKHQRA
HAGGKPHVCR	ECGQGFSRQS	HLIRHQRTHS	GEKPYICRKC	GRGFSRKSNL
IRHQRTHSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4928 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P10072 (англ.) . Архів оригіналу за 23 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.