HMG20A

Ідентифікатори

Символи

HMG20A, HMGX1, HMGXB1, high mobility group 20A

Зовнішні ІД

OMIM: 605534 MGI: 1914117 HomoloGene: 32399 GeneCards: HMG20A

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of neuron differentiation • transcription, DNA-templated • negative regulation of protein sumoylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10363


66867

Ensembl


ENSG00000140382


ENSMUSG00000032329

UniProt


Q9NP66


Q9DC33

RefSeq (мРНК)


NM_001304504 NM_001304505 NM_018200


NM_025812

RefSeq (білок)


NP_001291433 NP_001291434 NP_060670


NP_080088

Локус (UCSC)

Хр. 15: 77.42 – 77.49 Mb

Хр. 9: 56.33 – 56.4 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HMG20A (англ. High mobility group 20A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 40 144^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENLMTSSTL	PPLFADEDGS	KESNDLATTG	LNHPEVPYSS	GATSSTNNPE
FVEDLSQGQL	LQSESSNAAE	GNEQRHEDEQ	RSKRGGWSKG	RKRKKPLRDS
NAPKSPLTGY	VRFMNERREQ	LRAKRPEVPF	PEITRMLGNE	WSKLPPEEKQ
RYLDEADRDK	ERYMKELEQY	QKTEAYKVFS	RKTQDRQKGK	SHRQDAARQA
THDHEKETEV	KERSVFDIPI	FTEEFLNHSK	AREAELRQLR	KSNMEFEERN
AALQKHVESM	RTAVEKLEVD	VIQERSRNTV	LQQHLETLRQ	VLTSSFASMP
LPGSGETPTV	DTIDSYMNRL	HSIILANPQD	NENFIATVRE	VVNRLDR

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HMG20A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5001 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NP66 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.