HNRNPL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3R27, 3TO8

Ідентифікатори

Символи

HNRNPL, HNRPL, hnRNP-L, P/OKcl.14, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L

Зовнішні ІД

OMIM: 603083 MGI: 104816 HomoloGene: 1174 GeneCards: HNRNPL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • pre-mRNA intronic binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA CDS binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ribonucleoprotein granule • екзосома • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Пронуклеус • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA metabolic process • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • циркадний ритм • cellular response to amino acid starvation • positive regulation of translation • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • response to peptide • positive regulation of mRNA binding
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3191


15388

Ensembl


ENSG00000104824 ENSG00000282947


ENSMUSG00000015165

UniProt


P14866


Q8R081

RefSeq (мРНК)


NM_001005335 NM_001533


NM_177301

RefSeq (білок)


NP_001005335 NP_001524

NP_796275 NP_001389864 NP_001389865 NP_001389866 NP_001389867
NP_001389868

Локус (UCSC)

Хр. 19: 38.84 – 38.85 Mb

Хр. 7: 28.51 – 28.52 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 64 133^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRRLLPRAE	KRRRRLEQRQ	QPDEQRRRSG	AMVKMAAAGG	GGGGGRYYGG
GSEGGRAPKR	LKTDNAGDQH	GGGGGGGGGA	GAAGGGGGGE	NYDDPHKTPA
SPVVHIRGLI	DGVVEADLVE	ALQEFGPISY	VVVMPKKRQA	LVEFEDVLGA
CNAVNYAADN	QIYIAGHPAF	VNYSTSQKIS	RPGDSDDSRS	VNSVLLFTIL
NPIYSITTDV	LYTICNPCGP	VQRIVIFRKN	GVQAMVEFDS	VQSAQRAKAS
LNGADIYSGC	CTLKIEYAKP	TRLNVFKNDQ	DTWDYTNPNL	SGQGDPGSNP
NKRQRQPPLL	GDHPAEYGGP	HGGYHSHYHD	EGYGPPPPHY	EGRRMGPPVG
GHRRGPSRYG	PQYGHPPPPP	PPPEYGPHAD	SPVLMVYGLD	QSKMNCDRVF
NVFCLYGNVE	KVKFMKSKPG	AAMVEMADGY	AVDRAITHLN	NNFMFGQKLN
VCVSKQPAIM	PGQSYGLEDG	SCSYKDFSES	RNNRFSTPEQ	AAKNRIQHPS
NVLHFFNAPL	EVTEENFFEI	CDELGVKRPS	SVKVFSGKSE	RSSSGLLEWE
SKSDALETLG	FLNHYQMKNP	NGPYPYTLKL	CFSTAQHAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Pinol-Roma S., Swanson M.S., Gall J.G., Dreyfuss G. (1989). A novel heterogeneous nuclear RNP protein with a unique distribution on nascent transcripts. J. Cell Biol. 109: 2575—2587. PMID 2687284 DOI:10.1083/jcb.109.6.2575
Kuninger D.T., Izumi T., Papaconstantinou J., Mitra S. (2002). Human AP-endonuclease 1 and hnRNP-L interact with a nCaRE-like repressor element in the AP-endonuclease 1 promoter. Nucleic Acids Res. 30: 823—829. PMID 11809897 DOI:10.1093/nar/30.3.823
Shankarling G., Cole B.S., Mallory M.J., Lynch K.W. (2014). Transcriptome-wide RNA interaction profiling reveals physical and functional targets of hnRNP L in human T cells. Mol. Cell. Biol. 34: 71—83. PMID 24164894 DOI:10.1128/MCB.00740-13
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5045 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P14866 (англ.) . Архів оригіналу за 24 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.