HNRNPUL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ZRJ

Ідентифікатори

Символи

HNRNPUL1, E1B-AP5, E1BAP5, HNRPUL1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605800 MGI: 2443517 HomoloGene: 31419 GeneCards: HNRNPUL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • response to virus • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11100


232989

Ensembl


ENSG00000105323


ENSMUSG00000040725

UniProt


Q9BUJ2


Q8VDM6

RefSeq (мРНК)

NM_001301016 NM_007040 NM_144732 NM_144733 NM_144734
NM_001321208 NM_001321211


NM_144922 NM_178089 NM_001360789

RefSeq (білок)


NP_001287945 NP_001308137 NP_001308140 NP_008971 NP_653333


NP_659171 NP_835190 NP_001347718

Локус (UCSC)

Хр. 19: 41.26 – 41.31 Mb

Хр. 7: 25.42 – 25.45 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HNRNPUL1 (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 856 амінокислот, а молекулярна маса — 95 739^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVRRLKVNE	LREELQRRGL	DTRGLKAELA	ERLQAALEAE	EPDDERELDA
DDEPGRPGHI	NEEVETEGGS	ELEGTAQPPP	PGLQPHAEPG	GYSGPDGHYA
MDNITRQNQF	YDTQVIKQEN	ESGYERRPLE	MEQQQAYRPE	MKTEMKQGAP
TSFLPPEASQ	LKPDRQQFQS	RKRPYEENRG	RGYFEHREDR	RGRSPQPPAE
EDEDDFDDTL	VAIDTYNCDL	HFKVARDRSS	GYPLTIEGFA	YLWSGARASY
GVRRGRVCFE	MKINEEISVK	HLPSTEPDPH	VVRIGWSLDS	CSTQLGEEPF
SYGYGGTGKK	STNSRFENYG	DKFAENDVIG	CFADFECGND	VELSFTKNGK
WMGIAFRIQK	EALGGQALYP	HVLVKNCAVE	FNFGQRAEPY	CSVLPGFTFI
QHLPLSERIR	GTVGPKSKAE	CEILMMVGLP	AAGKTTWAIK	HAASNPSKKY
NILGTNAIMD	KMRVMGLRRQ	RNYAGRWDVL	IQQATQCLNR	LIQIAARKKR
NYILDQTNVY	GSAQRRKMRP	FEGFQRKAIV	ICPTDEDLKD	RTIKRTDEEG
KDVPDHAVLE	MKANFTLPDV	GDFLDEVLFI	ELQREEADKL	VRQYNEEGRK
AGPPPEKRFD	NRGGGGFRGR	GGGGGFQRYE	NRGPPGGNRG	GFQNRGGGSG
GGGNYRGGFN	RSGGGGYSQN	RWGNNNRDNN	NSNNRGSYNR	APQQQPPPQQ
PPPPQPPPQQ	PPPPPSYSPA	RNPPGASTYN	KNSNIPGSSA	NTSTPTVSSY
SPPQPSYSQP	PYNQGGYSQG	YTAPPPPPPP	PPAYNYGSYG	GYNPAPYTPP
PPPTAQTYPQ	PSYNQYQQYA	QQWNQYYQNQ	GQWPPYYGNY	DYGSYSGNTQ
GGTSTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kzhyshkowska J.G., Rusch A., Wolf H., Dobner T. (2003). Regulation of transcription by the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E1B-AP5 is mediated by complex formation with the novel bromodomain-containing protein BRD7. Biochem. J. 371: 385—393. PMID 12489984 DOI:10.1042/BJ20021281
Kzhyshkowska J., Kremmer E., Hofmann M., Wolf H., Dobner T. (2004). Protein arginine methylation during lytic adenovirus infection. Biochem. J. 383: 259—265. PMID 15242333 DOI:10.1042/BJ20040210
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17011 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BUJ2 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.