HOMER2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1I7A

Ідентифікатори

Символи

HOMER2, ACPD, CPD, HOMER-2, VESL-2, DFNA68, homer scaffolding protein 2, homer scaffold protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 604799 MGI: 1347354 HomoloGene: 3560 GeneCards: HOMER2

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant nonsyndromic deafness 68^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • synaptic receptor adaptor activity • actin binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • glutamate receptor binding • protein heterodimerization activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • neuronal cell body • postsynaptic membrane • дендрит (нейробіологія) • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • apical part of cell • stereocilium tip • cell projection • stereocilium • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • гіалоплазма • glutamatergic synapse • neuron projection
Біологічний процес	• G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • chemical homeostasis within a tissue • behavioral response to cocaine • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • слух • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of store-operated calcium entry • positive regulation of signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9455


26557

Ensembl


ENSG00000103942


ENSMUSG00000025813

UniProt


Q9NSB8


Q9QWW1

RefSeq (мРНК)


NM_004839 NM_199330 NM_199331 NM_199332


NM_001164086 NM_001164087 NM_011983 NM_177029

RefSeq (білок)


NP_004830 NP_955362


NP_001157558 NP_001157559 NP_036113

Локус (UCSC)

Хр. 15: 82.84 – 82.99 Mb

Хр. 7: 81.25 – 81.36 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HOMER2 (англ. Homer scaffolding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 627^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEQPIFTTR	AHVFQIDPNT	KKNWMPASKQ	AVTVSYFYDV	TRNSYRIISV
DGAKVIINST	ITPNMTFTKT	SQKFGQWADS	RANTVFGLGF	SSEQQLTKFA
EKFQEVKEAA	KIAKDKTQEK	IETSSNHSQE	SGRETPSSTQ	ASSVNGTDDE
KASHAGPANT	HLKSENDKLK	IALTQSAANV	KKWEIELQTL	RESNARLTTA
LQESAASVEQ	WKRQFSICRD	ENDRLRNKID	ELEEQCSEIN	REKEKNTQLK
RRIEELEAEL	REKETELKDL	RKQSEIIPQL	MSECEYVSEK	LEAAERDNQN
LEDKVRSLKT	DIEESKYRQR	HLKVELKSFL	EVLDGKIDDL	HDFRRGLSKL
GTDN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HOMER2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17513 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NSB8 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.