HOMER2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0a/Protein_HOMER2_PDB_1i7a.png/250px-Protein_HOMER2_PDB_1i7a.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HOMER2, ACPD, CPD, HOMER-2, VESL-2, DFNA68, homer scaffolding protein 2, homer scaffold protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604799 MGI: 1347354 HomoloGene: 3560 GeneCards: HOMER2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal dominant nonsyndromic deafness 68[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • synaptic receptor adaptor activity • actin binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • glutamate receptor binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • neuronal cell body • postsynaptic membrane • дендрит (нейробіологія) • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • apical part of cell • stereocilium tip • cell projection • stereocilium • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • гіалоплазма • glutamatergic synapse • neuron projection |
---|
Біологічний процес | • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • chemical homeostasis within a tissue • behavioral response to cocaine • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • слух • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of store-operated calcium entry • positive regulation of signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d2/PBB_GE_HOMER2_217080_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOMER2_217080_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004839 NM_199330 NM_199331 NM_199332 |
| | NM_001164086 NM_001164087 NM_011983 NM_177029 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001157558 NP_001157559 NP_036113 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 82.84 – 82.99 Mb | Хр. 7: 81.25 – 81.36 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HOMER2 (англ. Homer scaffolding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 627[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEQPIFTTR | | AHVFQIDPNT | | KKNWMPASKQ | | AVTVSYFYDV | | TRNSYRIISV |
DGAKVIINST | | ITPNMTFTKT | | SQKFGQWADS | | RANTVFGLGF | | SSEQQLTKFA |
EKFQEVKEAA | | KIAKDKTQEK | | IETSSNHSQE | | SGRETPSSTQ | | ASSVNGTDDE |
KASHAGPANT | | HLKSENDKLK | | IALTQSAANV | | KKWEIELQTL | | RESNARLTTA |
LQESAASVEQ | | WKRQFSICRD | | ENDRLRNKID | | ELEEQCSEIN | | REKEKNTQLK |
RRIEELEAEL | | REKETELKDL | | RKQSEIIPQL | | MSECEYVSEK | | LEAAERDNQN |
LEDKVRSLKT | | DIEESKYRQR | | HLKVELKSFL | | EVLDGKIDDL | | HDFRRGLSKL |
GTDN |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HOMER2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17513 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NSB8 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |