HOMER3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/46/Protein_HOMER3_PDB_2P8V.png/250px-Protein_HOMER3_PDB_2P8V.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2P8V, 3CVF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HOMER3, HOMER-3, VESL3, homer scaffolding protein 3, homer scaffold protein 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604800 MGI: 1347359 HomoloGene: 37972 GeneCards: HOMER3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • basal part of cell • міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • компонент клітини • glutamatergic synapse • дендрит (нейробіологія) • neuron projection |
---|
Біологічний процес | • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • сортування білків • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity • regulation of store-operated calcium entry |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/PBB_GE_HOMER3_222222_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOMER3_222222_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/20/PBB_GE_HOMER3_215489_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOMER3_215489_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/PBB_GE_HOMER3_204647_at_fs.png/250px-PBB_GE_HOMER3_204647_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001145721 NM_001145722 NM_001145724 NM_004838 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001139193 NP_001139194 NP_001139196 NP_004829 NP_001139194.1
| NP_001139196.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.93 – 18.94 Mb | Хр. 8: 70.28 – 70.29 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HOMER3 (англ. Homer scaffolding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 39 836[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTAREQPIF | | STRAHVFQID | | PATKRNWIPA | | GKHALTVSYF | | YDATRNVYRI |
ISIGGAKAII | | NSTVTPNMTF | | TKTSQKFGQW | | ADSRANTVYG | | LGFASEQHLT |
QFAEKFQEVK | | EAARLAREKS | | QDGGELTSPA | | LGLASHQVPP | | SPLVSANGPG |
EEKLFRSQSA | | DAPGPTERER | | LKKMLSEGSV | | GEVQWEAEFF | | ALQDSNNKLA |
GALREANAAA | | AQWRQQLEAQ | | RAEAERLRQR | | VAELEAQAAS | | EVTPTGEKEG |
LGQGQSLEQL | | EALVQTKDQE | | IQTLKSQTGG | | PREALEAAER | | EETQQKVQDL |
ETRNAELEHQ | | LRAMERSLEE | | ARAERERARA | | EVGRAAQLLD | | VSLFELSELR |
EGLARLAEAA | | P |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17514 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NSC5 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |