HOMER3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2P8V, 3CVF

Ідентифікатори

Символи

HOMER3, HOMER-3, VESL3, homer scaffolding protein 3, homer scaffold protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 604800 MGI: 1347359 HomoloGene: 37972 GeneCards: HOMER3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• basal part of cell • міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • компонент клітини • glutamatergic synapse • дендрит (нейробіологія) • neuron projection
Біологічний процес	• G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • сортування білків • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity • regulation of store-operated calcium entry
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9454


26558

Ensembl


ENSG00000051128


ENSMUSG00000003573

UniProt


Q9NSC5


Q99JP6

RefSeq (мРНК)


NM_001145721 NM_001145722 NM_001145724 NM_004838


NM_001146153 NM_011984

RefSeq (білок)

NP_001139193 NP_001139194 NP_001139196 NP_004829 NP_001139194.1
NP_001139196.1


NP_001139625 NP_036114

Локус (UCSC)

Хр. 19: 18.93 – 18.94 Mb

Хр. 8: 70.28 – 70.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HOMER3 (англ. Homer scaffolding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 39 836^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTAREQPIF	STRAHVFQID	PATKRNWIPA	GKHALTVSYF	YDATRNVYRI
ISIGGAKAII	NSTVTPNMTF	TKTSQKFGQW	ADSRANTVYG	LGFASEQHLT
QFAEKFQEVK	EAARLAREKS	QDGGELTSPA	LGLASHQVPP	SPLVSANGPG
EEKLFRSQSA	DAPGPTERER	LKKMLSEGSV	GEVQWEAEFF	ALQDSNNKLA
GALREANAAA	AQWRQQLEAQ	RAEAERLRQR	VAELEAQAAS	EVTPTGEKEG
LGQGQSLEQL	EALVQTKDQE	IQTLKSQTGG	PREALEAAER	EETQQKVQDL
ETRNAELEHQ	LRAMERSLEE	ARAERERARA	EVGRAAQLLD	VSLFELSELR
EGLARLAEAA	P

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17514 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NSC5 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.