IFT20

Ідентифікатори

Символи

IFT20, intraflagellar transport 20

Зовнішні ІД

OMIM: 614394 MGI: 1915585 HomoloGene: 49559 GeneCards: IFT20

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • opsin binding
Клітинна компонента	• cis-Golgi network • Golgi membrane • Центріоль • dendrite terminus • ciliary base • ciliary basal body • motile cilium • цитоплазма • photoreceptor connecting cilium • цитоскелет • cell projection • ciliary tip • photoreceptor outer segment • центросома • stereocilium • Мікроворсинки • intraciliary transport particle B • комплекс Ґольджі • kinociliary basal body • війка
Біологічний процес	• smoothened signaling pathway • cell projection organization • Нейрогенез • neural precursor cell proliferation • photoreceptor cell outer segment organization • cardiac muscle cell differentiation • розвиток нирки • protein localization to Golgi apparatus • opsin transport • regulation of canonical Wnt signaling pathway • visual learning • regulation of autophagosome assembly • regulation of cilium assembly • establishment of planar polarity • inner ear receptor cell stereocilium organization • protein localization to cilium • centrosome localization • cochlea development • intraciliary transport • intraciliary transport involved in cilium assembly • cilium assembly • protein localization to plasma membrane • Сперматогенез • regulation of platelet-derived growth factor receptor-alpha signaling pathway • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


90410


55978

Ensembl


ENSG00000109083


ENSMUSG00000001105

UniProt


Q8IY31


Q61025

RefSeq (мРНК)

NM_174887 NM_001267774 NM_001267775 NM_001267776 NM_001267777
NM_001267778


NM_018854

RefSeq (білок)

NP_001254703 NP_001254704 NP_001254705 NP_001254706 NP_001254707
NP_777547


NP_061342

Локус (UCSC)

Хр. 17: 28.33 – 28.34 Mb

Хр. 11: 78.43 – 78.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFT20 (англ. Intraflagellar transport 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 132 амінокислот, а молекулярна маса — 15 281^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKDILGEAG	LHFDELNKLR	VLDPEVTQQT	IELKEECKDF	VDKIGQFQKI
VGGLIELVDQ	LAKEAENEKM	KAIGARNLLK	SIAKQREAQQ	QQLQALIAEK
KMQLERYRVE	YEALCKVEAE	QNEFIDQFIF	QK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Follit J.A., Tuft R.A., Fogarty K.E., Pazour G.J. (2006). The intraflagellar transport protein IFT20 is associated with the Golgi complex and is required for cilia assembly. Mol. Biol. Cell. 17: 3781—3792. PMID 16775004 DOI:10.1091/mbc.E06-02-0133

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30989 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IY31 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.