IGF2BP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3KRM

Ідентифікатори

Символи

IGF2BP1, CRD-BP, CRDBP, IMP-1, IMP1, VICKZ1, ZBP1, insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608288 MGI: 1890357 HomoloGene: 4772 GeneCards: IGF2BP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• translation regulator activity • mRNA 3'-UTR binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA 5'-UTR binding • mRNA binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • CRD-mediated mRNA stability complex • cell projection • Філоподія • growth cone • dendritic spine • аксон • дендрит (нейробіологія) • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • lamellipodium • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• CRD-mediated mRNA stabilization • mRNA transport • negative regulation of translation • pallium cell proliferation in forebrain • neuronal stem cell population maintenance • RNA localization • regulation of translation • regulation of mRNA stability involved in response to stress • regulation of mRNA stability • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10642


140486

Ensembl


ENSG00000159217


ENSMUSG00000013415

UniProt


Q9NZI8


O88477

RefSeq (мРНК)


NM_001160423 NM_006546


NM_009951

RefSeq (білок)


NP_001153895 NP_006537


NP_034081 NP_001388383 NP_001388384 NP_001388385 NP_001388386

Локус (UCSC)

Хр. 17: 49 – 49.06 Mb

Хр. 11: 95.96 – 96.01 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IGF2BP1 (англ. Insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 63 481^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNKLYIGNLN	ESVTPADLEK	VFAEHKISYS	GQFLVKSGYA	FVDCPDEHWA
MKAIETFSGK	VELQGKRLEI	EHSVPKKQRS	RKIQIRNIPP	QLRWEVLDSL
LAQYGTVENC	EQVNTESETA	VVNVTYSNRE	QTRQAIMKLN	GHQLENHALK
VSYIPDEQIA	QGPENGRRGG	FGSRGQPRQG	SPVAAGAPAK	QQQVDIPLRL
LVPTQYVGAI	IGKEGATIRN	ITKQTQSKID	VHRKENAGAA	EKAISVHSTP
EGCSSACKMI	LEIMHKEAKD	TKTADEVPLK	ILAHNNFVGR	LIGKEGRNLK
KVEQDTETKI	TISSLQDLTL	YNPERTITVK	GAIENCCRAE	QEIMKKVREA
YENDVAAMSL	QSHLIPGLNL	AAVGLFPASS	SAVPPPPSSV	TGAAPYSSFM
QAPEQEMVQV	FIPAQAVGAI	IGKKGQHIKQ	LSRFASASIK	IAPPETPDSK
VRMVIITGPP	EAQFKAQGRI	YGKLKEENFF	GPKEEVKLET	HIRVPASAAG
RVIGKGGKTV	NELQNLTAAE	VVVPRDQTPD	ENDQVIVKII	GHFYASQMAQ
RKIRDILAQV	KQQHQKGQSN	QAQARRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках.

Література

Patel G.P., Ma S., Bag J. (2005). The autoregulatory translational control element of poly(A)-binding protein mRNA forms a heteromeric ribonucleoprotein complex. Nucleic Acids Res. 33: 7074—7089. PMID 16356927 DOI:10.1093/nar/gki1014
Rackham O., Brown C.M. (2004). Visualization of RNA-protein interactions in living cells: FMRP and IMP1 interact on mRNAs. EMBO J. 23: 3346—3355. PMID 15282548 DOI:10.1038/sj.emboj.7600341
Nielsen J., Kristensen M.A., Willemoes M., Nielsen F.C., Christiansen J. (2004). Sequential dimerization of human zipcode-binding protein IMP1 on RNA: a cooperative mechanism providing RNP stability. Nucleic Acids Res. 32: 4368—4376. PMID 15314207 DOI:10.1093/nar/gkh754
Patel G.P., Bag J. (2006). IMP1 interacts with poly(A)-binding protein (PABP) and the autoregulatory translational control element of PABP-mRNA through the KH III-IV domain. FEBS J. 273: 5678—5690. PMID 17212783 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05556.x
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Pan F., Huettelmaier S., Singer R.H., Gu W. (2007). ZBP2 facilitates binding of ZBP1 to beta-actin mRNA during transcription. Mol. Cell. Biol. 27: 8340—8351. PMID 17893325 DOI:10.1128/MCB.00972-07

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28866 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZI8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.