IL16 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1I16, 1X6D, 5FB8 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IL16, LCF, NPRprIL-16, IL-16, interleukin 16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603035 MGI: 1270855 HomoloGene: 18157 GeneCards: IL16 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytokine activity • CD4 receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • extracellular region • міжклітинний простір • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • induction of positive chemotaxis • хемотаксис • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • leukocyte chemotaxis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • transcription, DNA-templated • regulation of calcium ion transport • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001172128 NM_004513 NM_172217 NM_001352684 NM_001352685
| NM_001352686 |
| | NM_010551 NM_001360087 NM_001360088 NM_001360089 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001165599 NP_004504 NP_757366 NP_001339613 NP_001339614
| NP_001339615 |
| | NP_034681 NP_001347016 NP_001347017 NP_001347018 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 81.16 – 81.31 Mb | Хр. 7: 83.29 – 83.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IL16 (англ. Interleukin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 332 амінокислот, а молекулярна маса — 141 752[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESHSRAGKS | | RKSAKFRSIS | | RSLMLCNAKT | | SDDGSSPDEK | | YPDPFEISLA |
QGKEGIFHSS | | VQLADTSEAG | | PSSVPDLALA | | SEAAQLQAAG | | NDRGKTCRRI |
FFMKESSTAS | | SREKPGKLEA | | QSSNFLFPKA | | CHQRARSNST | | SVNPYCTREI |
DFPMTKKSAA | | PTDRQPYSLC | | SNRKSLSQQL | | DCPAGKAAGT | | SRPTRSLSTA |
QLVQPSGGLQ | | ASVISNIVLM | | KGQAKGLGFS | | IVGGKDSIYG | | PIGIYVKTIF |
AGGAAAADGR | | LQEGDEILEL | | NGESMAGLTH | | QDALQKFKQA | | KKGLLTLTVR |
TRLTAPPSLC | | SHLSPPLCRS | | LSSSTCITKD | | SSSFALESPS | | APISTAKPNY |
RIMVEVSLQK | | EAGVGLGIGL | | CSVPYFQCIS | | GIFVHTLSPG | | SVAHLDGRLR |
CGDEIVEISD | | SPVHCLTLNE | | VYTILSHCDP | | GPVPIIVSRH | | PDPQVSEQQL |
KEAVAQAVEN | | TKFGKERHQW | | SLEGVKRLES | | SWHGRPTLEK | | EREKNSAPPH |
RRAQKVMIRS | | SSDSSYMSGS | | PGGSPGSGSA | | EKPSSDVDIS | | THSPSLPLAR |
EPVVLSIASS | | RLPQESPPLP | | ESRDSHPPLR | | LKKSFEILVR | | KPMSSKPKPP |
PRKYFKSDSD | | PQKSLEEREN | | SSCSSGHTPP | | TCGQEARELL | | PLLLPQEDTA |
GRSPSASAGC | | PGPGIGPQTK | | SSTEGEPGWR | | RASPVTQTSP | | IKHPLLKRQA |
RMDYSFDTTA | | EDPWVRISDC | | IKNLFSPIMS | | ENHGHMPLQP | | NASLNEEEGT |
QGHPDGTPPK | | LDTANGTPKV | | YKSADSSTVK | | KGPPVAPKPA | | WFRQSLKGLR |
NRASDPRGLP | | DPALSTQPAP | | ASREHLGSHI | | RASSSSSSIR | | QRISSFETFG |
SSQLPDKGAQ | | RLSLQPSSGE | | AAKPLGKHEE | | GRFSGLLGRG | | AAPTLVPQQP |
EQVLSSGSPA | | ASEARDPGVS | | ESPPPGRQPN | | QKTLPPGPDP | | LLRLLSTQAE |
ESQGPVLKMP | | SQRARSFPLT | | RSQSCETKLL | | DEKTSKLYSI | | SSQVSSAVMK |
SLLCLPSSIS | | CAQTPCIPKE | | GASPTSSSNE | | DSAANGSAET | | SALDTGFSLN |
LSELREYTEG | | LTEAKEDDDG | | DHSSLQSGQS | | VISLLSSEEL | | KKLIEEVKVL |
DEATLKQLDG | | IHVTILHKEE | | GAGLGFSLAG | | GADLENKVIT | | VHRVFPNGLA |
SQEGTIQKGN | | EVLSINGKSL | | KGTTHHDALA | | ILRQAREPRQ | | AVIVTRKLTP |
EAMPDLNSST | | DSAASASAAS | | DVSVESTAEA | | TVCTVTLEKM | | SAGLGFSLEG |
GKGSLHGDKP | | LTINRIFKGA | | ASEQSETVQP | | GDEILQLGGT | | AMQGLTRFEA |
WNIIKALPDG | | PVTIVIRRKS | | LQSKETTAAG | | DS |
Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, хемотаксис, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.
Література
- Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bannert N., Avots A., Baier M., Serfling E., Kurth R. (1999). GA-binding protein factors, in concert with the coactivator CREB binding protein/p300, control the induction of the interleukin 16 promoter in T lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 1541—1546. PMID 9990060 DOI:10.1073/pnas.96.4.1541
- Bannert N., Baier M., Werner A., Kurth R. (1996). Interleukin-16 or not?. Nature. 381: 30—30. PMID 8609984 DOI:10.1038/381030a0
- Feske S., Giltnane J., Dolmetsch R., Staudt L.M., Rao A. (2001). Gene regulation mediated by calcium signals in T lymphocytes. Nat. Immunol. 2: 316—324. PMID 11276202 DOI:10.1038/86318
- Wilson K.C., Cruikshank W.W., Center D.M., Zhang Y. (2002). Prointerleukin-16 contains a functional CcN motif that regulates nuclear localization. Biochemistry. 41: 14306—14312. PMID 12450396 DOI:10.1021/bi020163v
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5980 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14005 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |