IRF5
IRF5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | IRF5, SLEB10, interferon regulatory factor 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: IRF5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ревматоїдний артрит, inflammatory bowel disease 14[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 128.94 – 128.95 Mb | Хр. 6: 29.53 – 29.54 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
IRF5 (англ. Interferon regulatory factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 044[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNQSIPVAPT | PPRRVRLKPW | LVAQVNSCQY | PGLQWVNGEK | KLFCIPWRHA | ||||
TRHGPSQDGD | NTIFKAWAKE | TGKYTEGVDE | ADPAKWKANL | RCALNKSRDF | ||||
RLIYDGPRDM | PPQPYKIYEV | CSNGPAPTDS | QPPEDYSFGA | GEEEEEEEEL | ||||
QRMLPSLSLT | EDVKWPPTLQ | PPTLRPPTLQ | PPTLQPPVVL | GPPAPDPSPL | ||||
APPPGNPAGF | RELLSEVLEP | GPLPASLPPA | GEQLLPDLLI | SPHMLPLTDL | ||||
EIKFQYRGRP | PRALTISNPH | GCRLFYSQLE | ATQEQVELFG | PISLEQVRFP | ||||
SPEDIPSDKQ | RFYTNQLLDV | LDRGLILQLQ | GQDLYAIRLC | QCKVFWSGPC | ||||
ASAHDSCPNP | IQREVKTKLF | SLEHFLNELI | LFQKGQTNTP | PPFEIFFCFG | ||||
EEWPDRKPRE | KKLITVQVVP | VAARLLLEMF | SGELSWSADS | IRLQISNPDL | ||||
KDRMVEQFKE | LHHIWQSQQR | LQPVAQAPPG | AGLGVGQGPW | PMHPAGMQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. (2001). Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes. J. Biol. Chem. 276: 23382—23390. PMID 11303025 DOI:10.1074/jbc.M101216200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Barnes B.J., Kellum M.J., Field A.E., Pitha P.M. (2002). Multiple regulatory domains of IRF-5 control activation, cellular localization, and induction of chemokines that mediate recruitment of T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 22: 5721—5740. PMID 12138184 DOI:10.1128/MCB.22.16.5721-5740.2002
- Lin R., Yang L., Arguello M., Penafuerte C., Hiscott J. (2005). A CRM1-dependent nuclear export pathway is involved in the regulation of IRF-5 subcellular localization. J. Biol. Chem. 280: 3088—3095. PMID 15556946 DOI:10.1074/jbc.M408452200
- Balkhi M.Y., Fitzgerald K.A., Pitha P.M. (2008). Functional regulation of MyD88-activated interferon regulatory factor 5 by K63-linked polyubiquitination. Mol. Cell. Biol. 28: 7296—7308. PMID 18824541 DOI:10.1128/MCB.00662-08
- Chang Foreman H.C., Van Scoy S., Cheng T.F., Reich N.C. (2012). Activation of interferon regulatory factor 5 by site specific phosphorylation. PLoS ONE. 7: E33098—E33098. PMID 22412986 DOI:10.1371/journal.pone.0033098
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з IRF5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6120 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13568 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 7
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|