ISG20

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WLJ

Ідентифікатори

Символи

ISG20, CD25, HEM45, interferon stimulated exonuclease gene 20kDa, interferon stimulated exonuclease gene 20

Зовнішні ІД

OMIM: 604533 MGI: 1928895 HomoloGene: 31081 GeneCards: ISG20

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 3'-5'-exoribonuclease activity • single-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • exoribonuclease II activity • зв'язування з іоном металу • U3 snoRNA binding • U2 snRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • U1 snRNA binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • Тільце Кахаля • PML body • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес	• процес імунної системи • response to virus • Деградація РНК • negative regulation of viral genome replication • DNA catabolic process, exonucleolytic • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • rRNA processing • вроджений імунітет • проліферація • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3669


57444

Ensembl


ENSG00000172183


ENSMUSG00000039236

UniProt


Q96AZ6


Q9JL16

RefSeq (мРНК)

NM_001303233 NM_001303234 NM_001303235 NM_001303236 NM_001303237
NM_002201


NM_001113527 NM_001291220 NM_001291221 NM_020583

RefSeq (білок)

NP_001290162 NP_001290163 NP_001290164 NP_001290165 NP_001290166
NP_002192


NP_001106999 NP_001278149 NP_001278150 NP_065608

Локус (UCSC)

Хр. 15: 88.64 – 88.66 Mb

Хр. 7: 78.56 – 78.57 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ISG20 (англ. Interferon stimulated exonuclease gene 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 363^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGSREVVAM	DCEMVGLGPH	RESGLARCSL	VNVHGAVLYD	KFIRPEGEIT
DYRTRVSGVT	PQHMVGATPF	AVARLEILQL	LKGKLVVGHD	LKHDFQALKE
DMSGYTIYDT	STDRLLWREA	KLDHCRRVSL	RVLSERLLHK	SIQNSLLGHS
SVEDARATME	LYQISQRIRA	RRGLPRLAVS	D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, процесмнг рРНК, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Pentecost B.T. (1998). Expression and estrogen regulation of the HEM45 mRNA in human tumor lines and in the rat uterus. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 64: 25—33. PMID 9569007 DOI:10.1016/S0960-0760(97)00140-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nguyen L.H., Espert L., Mechti N., Wilson D.M. III (2001). The human interferon- and estrogen-regulated ISG20/HEM45 gene product degrades single-stranded RNA and DNA in vitro. Biochemistry. 40: 7174—7179. PMID 11401564 DOI:10.1021/bi010141t
Degols G., Eldin P., Mechti N. (2007). ISG20, an actor of the innate immune response. Biochimie. 89: 831—835. PMID 17445960 DOI:10.1016/j.biochi.2007.03.006

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6130 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96AZ6 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.