ISG20 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/df/Protein_ISG20_PDB_1wlj.png/250px-Protein_ISG20_PDB_1wlj.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ISG20, CD25, HEM45, interferon stimulated exonuclease gene 20kDa, interferon stimulated exonuclease gene 20 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604533 MGI: 1928895 HomoloGene: 31081 GeneCards: ISG20 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 3'-5'-exoribonuclease activity • single-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • exoribonuclease II activity • зв'язування з іоном металу • U3 snoRNA binding • U2 snRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • U1 snRNA binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Тільце Кахаля • PML body • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • процес імунної системи • response to virus • Деградація РНК • negative regulation of viral genome replication • DNA catabolic process, exonucleolytic • defense response to virus • type I interferon signaling pathway • rRNA processing • вроджений імунітет • проліферація • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/eb/PBB_GE_ISG20_33304_at_fs.png/250px-PBB_GE_ISG20_33304_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/84/PBB_GE_ISG20_204698_at_fs.png/250px-PBB_GE_ISG20_204698_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001303233 NM_001303234 NM_001303235 NM_001303236 NM_001303237
| NM_002201 |
| | NM_001113527 NM_001291220 NM_001291221 NM_020583 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001290162 NP_001290163 NP_001290164 NP_001290165 NP_001290166
| NP_002192 |
| | NP_001106999 NP_001278149 NP_001278150 NP_065608 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 88.64 – 88.66 Mb | Хр. 7: 78.56 – 78.57 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ISG20 (англ. Interferon stimulated exonuclease gene 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 363[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGSREVVAM | | DCEMVGLGPH | | RESGLARCSL | | VNVHGAVLYD | | KFIRPEGEIT |
DYRTRVSGVT | | PQHMVGATPF | | AVARLEILQL | | LKGKLVVGHD | | LKHDFQALKE |
DMSGYTIYDT | | STDRLLWREA | | KLDHCRRVSL | | RVLSERLLHK | | SIQNSLLGHS |
SVEDARATME | | LYQISQRIRA | | RRGLPRLAVS | | D |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, процесмнг рРНК, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Pentecost B.T. (1998). Expression and estrogen regulation of the HEM45 mRNA in human tumor lines and in the rat uterus. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 64: 25—33. PMID 9569007 DOI:10.1016/S0960-0760(97)00140-4
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nguyen L.H., Espert L., Mechti N., Wilson D.M. III (2001). The human interferon- and estrogen-regulated ISG20/HEM45 gene product degrades single-stranded RNA and DNA in vitro. Biochemistry. 40: 7174—7179. PMID 11401564 DOI:10.1021/bi010141t
- Degols G., Eldin P., Mechti N. (2007). ISG20, an actor of the innate immune response. Biochimie. 89: 831—835. PMID 17445960 DOI:10.1016/j.biochi.2007.03.006
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6130 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96AZ6 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |