JADE3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | JADE3, JADE-3, PHF16, jade family PHD finger 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300618 MGI: 2148019 HomoloGene: 40981 GeneCards: JADE3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • histone acetyltransferase complex |
---|
Біологічний процес | • histone H4-K16 acetylation • histone H4-K8 acetylation • histone H4-K12 acetylation • histone H3 acetylation • histone H4-K5 acetylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/PBB_GE_PHF16_204866_at_fs.png/250px-PBB_GE_PHF16_204866_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001276613 NP_955021 NP_001393168 NP_001393169 NP_001393170 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 46.91 – 47.06 Mb | Хр. X: 20.29 – 20.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
JADE3 (англ. Jade family PHD finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 823 амінокислот, а молекулярна маса — 93 808[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKRHRPVSSS | | DSSDESPSTS | | FTSGSMYRIK | | SKIPNEHKKP | | AEVFRKDLIS |
AMKLPDSHHI | | NPDSYYLFAD | | TWKEEWEKGV | | QVPASPDTVP | | QPSLRIIAEK |
VKDVLFIRPR | | KYIHCSSPDT | | TEPGYINIME | | LAASVCRYDL | | DDMDIFWLQE |
LNEDLAEMGC | | GPVDENLMEK | | TVEVLERHCH | | ENMNHAIETE | | EGLGIEYDED |
VICDVCRSPD | | SEEGNDMVFC | | DKCNVCVHQA | | CYGILKVPEG | | SWLCRSCVLG |
IYPQCVLCPK | | KGGALKTTKT | | GTKWAHVSCA | | LWIPEVSIAC | | PERMEPITKI |
SHIPPSRWAL | | VCNLCKLKTG | | ACIQCSIKSC | | ITAFHVTCAF | | EHGLEMKTIL |
DEGDEVKFKS | | YCLKHSQNRQ | | KLGEAEYPHH | | RAKEQSQAKS | | EKTSLRAQKL |
RELEEEFYSL | | VRVEDVAAEL | | GMPTLAVDFI | | YNYWKLKRKS | | NFNKPLFPPK |
EDEENGLVQP | | KEESIHTRMR | | MFMHLRQDLE | | RVRNLCYMIS | | RREKLKLSHN |
KIQEQIFGLQ | | VQLLNQEIDA | | GLPLTNALEN | | SLFYPPPRIT | | LKLKMPKSTP |
EDHRNSSTET | | DQQPHSPDSS | | SSVHSIRNMQ | | VPQESLEMRT | | KSYPRYPLES |
KNNRLLASLS | | HSRSEAKESS | | PAWRTPSSEC | | YHGQSLGKPL | | VLQAALHGQS |
SIGNGKSQPN | | SKFAKSNGLE | | GSWSGNVTQK | | DSSSEMFCDQ | | EPVFSPHLVS |
QGSFRKSTVE | | HFSRSFKETT | | NRWVKNTEDL | | QCYVKPTKNM | | SPKEQFWGRQ |
VLRRSAGRAP | | YQENDGYCPD | | LELSDSEAES | | DGNKEKVRVR | | KDSSDRENPP |
HDSRRDCHGK | | SKTHPLSHSS | | MQR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development. Mol. Cell. Biol. 23: 8553—8562. PMID 14612400 DOI:10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22982 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92613 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|