KATNB1

Ідентифікатори

Символи

KATNB1, KAT, LIS6, katanin regulatory subunit B1

Зовнішні ІД

OMIM: 602703 MGI: 1921437 HomoloGene: 4302 GeneCards: KATNB1

Пов'язані генетичні захворювання

lissencephaly 6 with microcephaly, Лісенцефалія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity • microtubule-severing ATPase activity • microtubule binding • dynein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центр організації мікротрубочок • growth cone • клітинне ядро • аксон • spindle pole • мембрана • центросома • midbody • мікротрубочка • neuronal cell body • microtubule cytoskeleton • клітинна мембрана • цитоскелет • katanin complex • гіалоплазма • веретено поділу
Біологічний процес	• positive regulation of neuron projection development • клітинний цикл • negative regulation of microtubule depolymerization • поділ клітини • сортування білків • microtubule severing • positive regulation of cell death • positive regulation of microtubule depolymerization • microtubule depolymerization • mitotic chromosome movement towards spindle pole
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10300


74187

Ensembl


ENSG00000140854


ENSMUSG00000031787

UniProt


Q9BVA0


Q8BG40

RefSeq (мРНК)


NM_005886


NM_028805

RefSeq (білок)


NP_005877


NP_083081

Локус (UCSC)

Хр. 16: 57.74 – 57.76 Mb

Хр. 8: 95.81 – 95.83 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KATNB1 (англ. Katanin regulatory subunit B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 655 амінокислот, а молекулярна маса — 72 334^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPVVTKTA	WKLQEIVAHA	SNVSSLVLGK	ASGRLLATGG	DDCRVNLWSI
NKPNCIMSLT	GHTSPVESVR	LNTPEELIVA	GSQSGSIRVW	DLEAAKILRT
LMGHKANICS	LDFHPYGEFV	ASGSQDTNIK	LWDIRRKGCV	FRYRGHSQAV
RCLRFSPDGK	WLASAADDHT	VKLWDLTAGK	MMSEFPGHTG	PVNVVEFHPN
EYLLASGSSD	RTIRFWDLEK	FQVVSCIEGE	PGPVRSVLFN	PDGCCLYSGC
QDSLRVYGWE	PERCFDVVLV	NWGKVADLAI	CNDQLIGVAF	SQSNVSSYVV
DLTRVTRTGT	VARDPVQDHR	PLAQPLPNPS	APLRRIYERP	STTCSKPQRV
KQNSESERRS	PSSEDDRDER	ESRAEIQNAE	DYNEIFQPKN	SISRTPPRRS
EPFPAPPEDD	AATAKEAAKP	SPAMDVQFPV	PNLEVLPRPP	VVASTPAPKA
EPAIIPATRN	EPIGLKASDF	LPAVKIPQQA	ELVDEDAMSQ	IRKGHDTMCV
VLTSRHKNLD	TVRAVWTMGD	IKTSVDSAVA	INDLSVVVDL	LNIVNQKASL
WKLDLCTTVL	PQIEKLLQSK	YESYVQTGCT	SLKLILQRFL	PLITDMLAAP
PSVGVDISRE	ERLHKCRLCY	KQLKSISGLV	KSKSGLSGRH	GSTFRELHLL
MASLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McNally F.J., Thomas S. (1998). Katanin is responsible for the M-phase microtubule-severing activity in Xenopus eggs. Mol. Biol. Cell. 9: 1847—1861. PMID 9658175 DOI:10.1091/mbc.9.7.1847
McNally K.P., Bazirgan O.A., McNally F.J. (2000). Two domains of p80 katanin regulate microtubule severing and spindle pole targeting by p60 katanin. J. Cell Sci. 113: 1623—1633. PMID 10751153

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KATNB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6217 (англ.) . Архів оригіналу за 29 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BVA0 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.