KDM8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3UYJ, 4AAP, 4GAZ, 4GJY, 4GJZ, 4QU1

Ідентифікатори

Символи

KDM8, JMJD5, lysine demethylase 8

Зовнішні ІД

OMIM: 611917 MGI: 1924285 HomoloGene: 49791 GeneCards: KDM8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• dioxygenase activity • chromatin binding • oxidoreductase activity • зв'язування з іоном металу • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • histone demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • aminopeptidase activity • endopeptidase activity • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • methylated histone binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • хромосома
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • клітинний цикл • G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • transcription, DNA-templated • протеоліз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • protein destabilization • circadian regulation of gene expression • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79831


77035

Ensembl


ENSG00000155666


ENSMUSG00000030752

UniProt


Q8N371


Q9CXT6

RefSeq (мРНК)


NM_001145348 NM_024773


NM_029842

RefSeq (білок)


NP_001138820 NP_079049


NP_084118

Локус (UCSC)

Хр. 16: 27.2 – 27.22 Mb

Хр. 7: 125.04 – 125.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KDM8 (англ. Lysine demethylase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 47 270^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGDTHCPAE	PLAREGTLWE	ALRALLPHSK	EDLKLDLGEK	VERSVVTLLQ
RATELFYEGR	RDECLQSSEV	ILDYSWEKLN	TGTWQDVDKD	WRRVYAIGCL
LKALCLCQAP	EDANTVAAAL	RVCDMGLLMG	AAILGDILLK	VAAILQTHLP
GKRPARGSLP	EQPCTKKARA	DHGLIPDVKL	EKTVPRLHRP	SLQHFREQFL
VPGRPVILKG	VADHWPCMQK	WSLEYIQEIA	GCRTVPVEVG	SRYTDEEWSQ
TLMTVNEFIS	KYIVNEPRDV	GYLAQHQLFD	QIPELKQDIS	IPDYCSLGDG
EEEEITINAW	FGPQGTISPL	HQDPQQNFLV	QVMGRKYIRL	YSPQESGALY
PHDTHLLHNT	SQVDVENPDL	EKFPKFAKAP	FLSCILSPGE	ILFIPVKYWH
YVRALDLSFS	VSFWWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25840 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N371 (англ.) . Архів оригіналу за 24 квітня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.