KIF1C

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2G1L

Ідентифікатори

Символи

KIF1C, LTXS1, SATX2, SAX2, SPAX2, SPG58, kinesin family member 1C

Зовнішні ІД

OMIM: 603060 MGI: 1098260 HomoloGene: 4821 GeneCards: KIF1C

Пов'язані генетичні захворювання

spastic ataxia 2^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding • microtubule motor activity • nucleotide binding • ATPase activity • cytoskeletal motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding • plus-end-directed microtubule motor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • мікротрубочка • цитоскелет • ендоплазматичний ретикулум • Кінезин • аксон • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • axon cytoplasm
Біологічний процес	• cytoskeleton-dependent intracellular transport • microtubule-based movement • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • vesicle-mediated transport • anterograde neuronal dense core vesicle transport • retrograde neuronal dense core vesicle transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10749


16562

Ensembl


ENSG00000129250


ENSMUSG00000020821

UniProt


O43896


O35071

RefSeq (мРНК)


NM_006612


NM_153103

RefSeq (білок)


NP_006603


NP_694743

Локус (UCSC)

Хр. 17: 5 – 5.03 Mb

Хр. 11: 70.7 – 70.73 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KIF1C (англ. Kinesin family member 1C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 103 амінокислот, а молекулярна маса — 122 947^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGASVKVAV	RVRPFNARET	SQDAKCVVSM	QGNTTSIINP	KQSKDAPKSF
TFDYSYWSHT	STEDPQFASQ	QQVYRDIGEE	MLLHAFEGYN	VCIFAYGQTG
AGKSYTMMGR	QEPGQQGIVP	QLCEDLFSRV	SENQSAQLSY	SVEVSYMEIY
CERVRDLLNP	KSRGSLRVRE	HPILGPYVQD	LSKLAVTSYA	DIADLMDCGN
KARTVAATNM	NETSSRSHAV	FTIVFTQRCH	DQLTGLDSEK	VSKISLVDLA
GSERADSSGA	RGMRLKEGAN	INKSLTTLGK	VISALADMQS	KKRKSDFIPY
RDSVLTWLLK	ENLGGNSRTA	MIAALSPADI	NYEETLSTLR	YADRTKQIRC
NAIINEDPNA	RLIRELQEEV	ARLRELLMAQ	GLSASALEGL	KTEEGSVRGA
LPAVSSPPAP	VSPSSPTTHN	GELEPSFSPN	TESQIGPEEA	MERLQETEKI
IAELNETWEE	KLRKTEALRM	EREALLAEMG	VAVREDGGTV	GVFSPKKTPH
LVNLNEDPLM	SECLLYHIKD	GVTRVGQVDM	DIKLTGQFIR	EQHCLFRSIP
QPDGEVVVTL	EPCEGAETYV	NGKLVTEPLV	LKSGNRIVMG	KNHVFRFNHP
EQARLERERG	VPPPPGPPSE	PVDWNFAQKE	LLEQQGIDIK	LEMEKRLQDL
ENQYRKEKEE	ADLLLEQQRL	YADSDSGDDS	DKRSCEESWR	LISSLREQLP
PTTVQTIVKR	CGLPSSGKRR	APRRVYQIPQ	RRRLQGKDPR	WATMADLKMQ
AVKEICYEVA	LADFRHGRAE	IEALAALKMR	ELCRTYGKPD	GPGDAWRAVA
RDVWDTVGEE	EGGGAGSGGG	SEEGARGAEV	EDLRAHIDKL	TGILQEVKLQ
NSSKDRELQA	LRDRMLRMER	VIPLAQDHED	ENEEGGEVPW	APPEGSEAAE
EAAPSDRMPS	ARPPSPPLSS	WERVSRLMEE	DPAFRRGRLR	WLKQEQLRLQ
GLQGSGGRGG	GLRRPPARFV	PPHDCKLRFP	FKSNPQHRES	WPGMGSGEAP
TPLQPPEEVT	PHPATPARRP	PSPRRSHHPR	RNSLDGGGRS	RGAGSAQPEP
QHFQPKKHNS	YPQPPQPYPA	QRPPGPRYPP	YTTPPRMRRQ	RSAPDLKESG
AAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6317 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O43896 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.