KPNA2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1EFX, 1QGK, 1QGR, 3FEX, 3FEY, 3WPT, 4E4V, 4WV6

Ідентифікатори

Символи

KPNA2, IPOA1, QIP2, RCH1, SRP1alpha, Karyopherin alpha 2, SRP1-alpha, karyopherin subunit alpha 2, PTAC58

Зовнішні ІД

OMIM: 600685 MGI: 103561 HomoloGene: 1708 GeneCards: KPNA2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • RNA binding • nuclear import signal receptor activity
Клітинна компонента	• мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • host cell • extrinsic component of postsynaptic specialization membrane • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• regulation of DNA recombination • protein import into nucleus • DNA metabolic process • protein transport • GO:0022415 viral process • NLS-bearing protein import into nucleus • modulation by virus of host cellular process • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0015915 транспорт • postsynapse to nucleus signaling pathway • entry of viral genome into host nucleus through nuclear pore complex via importin • positive regulation of viral life cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3838


16647

Ensembl


ENSG00000182481


ENSMUSG00000018362

UniProt


P52292


P52293

RefSeq (мРНК)


NM_002266 NM_001320611


NM_010655

RefSeq (білок)


NP_001307540 NP_002257


NP_034785

Локус (UCSC)

Хр. 17: 68.04 – 68.05 Mb

Хр. 11: 106.88 – 106.89 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KPNA2 (англ. Karyopherin subunit alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 57 862^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTNENANTP	AARLHRFKNK	GKDSTEMRRR	RIEVNVELRK	AKKDDQMLKR
RNVSSFPDDA	TSPLQENRNN	QGTVNWSVDD	IVKGINSSNV	ENQLQATQAA
RKLLSREKQP	PIDNIIRAGL	IPKFVSFLGR	TDCSPIQFES	AWALTNIASG
TSEQTKAVVD	GGAIPAFISL	LASPHAHISE	QAVWALGNIA	GDGSVFRDLV
IKYGAVDPLL	ALLAVPDMSS	LACGYLRNLT	WTLSNLCRNK	NPAPPIDAVE
QILPTLVRLL	HHDDPEVLAD	TCWAISYLTD	GPNERIGMVV	KTGVVPQLVK
LLGASELPIV	TPALRAIGNI	VTGTDEQTQV	VIDAGALAVF	PSLLTNPKTN
IQKEATWTMS	NITAGRQDQI	QQVVNHGLVP	FLVSVLSKAD	FKTQKEAVWA
VTNYTSGGTV	EQIVYLVHCG	IIEPLMNLLT	AKDTKIILVI	LDAISNIFQA
AEKLGETEKL	SIMIEECGGL	DKIEALQNHE	NESVYKASLS	LIEKYFSVEE
EEDQNVVPET	TSEGYTFQVQ	DGAPGTFNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Weis K., Mattaj I.W., Lamond A.I. (1995). Identification of hSRP1 alpha as a functional receptor for nuclear localization sequences. Science. 268: 1049—1053. PMID 7754385 DOI:10.1126/science.7754385
Doerr S., Schlicker M., Hansmann I. (2001). Genomic structure of karyopherin alpha2 (KPNA2) within a low-copy repeat on chromosome 17q23-q24 and mutation analysis in patients with Russell-Silver syndrome. Hum. Genet. 109: 479—486. PMID 11735022 DOI:10.1007/s004390100605
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cuomo C.A., Kirch S.A., Gyuris J., Brent R., Oettinger M.A. (1994). Rch1, a protein that specifically interacts with the RAG-1 recombination-activating protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6156—6160. PMID 8016130 DOI:10.1073/pnas.91.13.6156
Moroianu J., Hijikata M., Blobel G., Radu A. (1995). Mammalian karyopherin alpha 1 beta and alpha 2 beta heterodimers: alpha 1 or alpha 2 subunit binds nuclear localization signal and beta subunit interacts with peptide repeat-containing nucleoporins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 6532—6536. PMID 7604027 DOI:10.1073/pnas.92.14.6532
Kutay U., Bischoff F.R., Kostka S., Kraft R., Goerlich D. (1997). Export of importin-alpha from the nucleus is mediated by a specific nuclear transport factor. Cell. 90: 1061—1071. PMID 9323134 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80372-4

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6395 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P52292 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.