LARP6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MTF, 2MTG | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LARP6, ACHN, La ribonucleoprotein domain family member 6, La ribonucleoprotein 6, translational regulator |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611300 MGI: 1914807 HomoloGene: 32408 GeneCards: LARP6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific mRNA binding • myosin binding • RNA stem-loop binding • mRNA 5'-UTR binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • Полісома • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • regulation of translation • positive regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA binding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_197958 NM_001286679 NM_018357 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001273608 NP_060827 NP_932062 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 70.83 – 70.85 Mb | Хр. 9: 60.62 – 60.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LARP6 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 54 737[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQSGGEARP | | GPKTAVQIRV | | AIQEAEDVDE | | LEDEEEGAET | | RGAGDPARYL |
SPGWGSASEE | | EPSRGHSGTT | | ASGGENERED | | LEQEWKPPDE | | ELIKKLVDQI |
EFYFSDENLE | | KDAFLLKHVR | | RNKLGYVSVK | | LLTSFKKVKH | | LTRDWRTTAH |
ALKYSVVLEL | | NEDHRKVRRT | | TPVPLFPNEN | | LPSKMLLVYD | | LYLSPKLWAL |
ATPQKNGRVQ | | EKVMEHLLKL | | FGTFGVISSV | | RILKPGRELP | | PDIRRISSRY |
SQVGTQECAI | | VEFEEVEAAI | | KAHEFMITES | | QGKENMKAVL | | IGMKPPKKKP |
AKDKNHDEEP | | TASIHLNKSL | | NKRVEELQYM | | GDESSANSSS | | DPESNPTSPM |
AGRRHAATNK | | LSPSGHQNLF | | LSPNASPCTS | | PWSSPLAQRK | | GVSRKSPLAE |
EGRLNCSTSP | | EIFRKCMDYS | | SDSSVTPSGS | | PWVRRRRQAE | | MGTQEKSPGT |
SPLLSRKMQT | | ADGLPVGVLR | | LPRGPDNTRG | | FHGHERSRAC | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Valavanis C., Wang Z., Sun D., Vaine M., Schwartz L.M. (2007). Acheron, a novel member of the Lupus antigen family, is induced during the programmed cell death of skeletal muscles in the moth Manduca sexta. Gene. 393: 101—109. PMID 17383118 DOI:10.1016/j.gene.2007.01.033
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cai L., Fritz D., Stefanovic L., Stefanovic B. (2010). Nonmuscle myosin-dependent synthesis of type I collagen. J. Mol. Biol. 401: 564—578. PMID 20603131 DOI:10.1016/j.jmb.2010.06.057
- Challa A.A., Stefanovic B. (2011). A novel role of vimentin filaments: binding and stabilization of collagen mRNAs. Mol. Cell. Biol. 31: 3773—3789. PMID 21746880 DOI:10.1128/MCB.05263-11
- Manojlovic Z., Stefanovic B. (2012). A novel role of RNA helicase A in regulation of translation of type I collagen mRNAs. RNA. 18: 321—334. PMID 22190748 DOI:10.1261/rna.030288.111
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24012 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BRS8 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |