LARP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MTF, 2MTG

Ідентифікатори

Символи

LARP6, ACHN, La ribonucleoprotein domain family member 6, La ribonucleoprotein 6, translational regulator

Зовнішні ІД

OMIM: 611300 MGI: 1914807 HomoloGene: 32408 GeneCards: LARP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific mRNA binding • myosin binding • RNA stem-loop binding • mRNA 5'-UTR binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • Полісома • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • regulation of translation • positive regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA binding
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55323


67557

Ensembl


ENSG00000166173


ENSMUSG00000034839

UniProt


Q9BRS8


Q8BN59

RefSeq (мРНК)


NM_197958 NM_001286679 NM_018357


NM_026235

RefSeq (білок)


NP_001273608 NP_060827 NP_932062


NP_080511

Локус (UCSC)

Хр. 15: 70.83 – 70.85 Mb

Хр. 9: 60.62 – 60.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LARP6 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 54 737^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQSGGEARP	GPKTAVQIRV	AIQEAEDVDE	LEDEEEGAET	RGAGDPARYL
SPGWGSASEE	EPSRGHSGTT	ASGGENERED	LEQEWKPPDE	ELIKKLVDQI
EFYFSDENLE	KDAFLLKHVR	RNKLGYVSVK	LLTSFKKVKH	LTRDWRTTAH
ALKYSVVLEL	NEDHRKVRRT	TPVPLFPNEN	LPSKMLLVYD	LYLSPKLWAL
ATPQKNGRVQ	EKVMEHLLKL	FGTFGVISSV	RILKPGRELP	PDIRRISSRY
SQVGTQECAI	VEFEEVEAAI	KAHEFMITES	QGKENMKAVL	IGMKPPKKKP
AKDKNHDEEP	TASIHLNKSL	NKRVEELQYM	GDESSANSSS	DPESNPTSPM
AGRRHAATNK	LSPSGHQNLF	LSPNASPCTS	PWSSPLAQRK	GVSRKSPLAE
EGRLNCSTSP	EIFRKCMDYS	SDSSVTPSGS	PWVRRRRQAE	MGTQEKSPGT
SPLLSRKMQT	ADGLPVGVLR	LPRGPDNTRG	FHGHERSRAC	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Valavanis C., Wang Z., Sun D., Vaine M., Schwartz L.M. (2007). Acheron, a novel member of the Lupus antigen family, is induced during the programmed cell death of skeletal muscles in the moth Manduca sexta. Gene. 393: 101—109. PMID 17383118 DOI:10.1016/j.gene.2007.01.033
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cai L., Fritz D., Stefanovic L., Stefanovic B. (2010). Nonmuscle myosin-dependent synthesis of type I collagen. J. Mol. Biol. 401: 564—578. PMID 20603131 DOI:10.1016/j.jmb.2010.06.057
Challa A.A., Stefanovic B. (2011). A novel role of vimentin filaments: binding and stabilization of collagen mRNAs. Mol. Cell. Biol. 31: 3773—3789. PMID 21746880 DOI:10.1128/MCB.05263-11
Manojlovic Z., Stefanovic B. (2012). A novel role of RNA helicase A in regulation of translation of type I collagen mRNAs. RNA. 18: 321—334. PMID 22190748 DOI:10.1261/rna.030288.111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24012 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BRS8 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.