LNPEP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PJ6, 4P8Q, 4Z7I, 5C97

Ідентифікатори

Символи

LNPEP, CAP, IRAP, P-LAP, PLAP, leucyl/cystinyl aminopeptidase, leucyl and cystinyl aminopeptidase

Зовнішні ІД

OMIM: 151300 MGI: 2387123 HomoloGene: 21148 GeneCards: LNPEP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• пептидний зв'язок • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aminopeptidase activity • metallopeptidase activity • metalloaminopeptidase activity • hydrolase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • extracellular region • lysosomal membrane • perinuclear region of cytoplasm • early endosome lumen • cytoplasmic vesicle membrane
Біологічний процес	• SMAD protein signal transduction • жіноча вагітність • cell-cell signaling • protein polyubiquitination • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • протеоліз • regulation of blood pressure • GO:0044257 protein catabolic process • membrane organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • peptide catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4012


240028

Ensembl


ENSG00000113441


ENSMUSG00000023845

UniProt


Q9UIQ6


Q8C129

RefSeq (мРНК)


NM_175920 NM_005575


NM_172827

RefSeq (білок)


NP_005566 NP_787116


NP_766415

Локус (UCSC)

Хр. 5: 96.94 – 97.04 Mb

Хр. 17: 17.74 – 17.85 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LNPEP (англ. Leucyl and cystinyl aminopeptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 025 амінокислот, а молекулярна маса — 117 349^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPFTNDRLQ	LPRNMIENSM	FEEEPDVVDL	AKEPCLHPLE	PDEVEYEPRG
SRLLVRGLGE	HEMEEDEEDY	ESSAKLLGMS	FMNRSSGLRN	SATGYRQSPD
GACSVPSART	MVVCAFVIVV	AVSVIMVIYL	LPRCTFTKEG	CHKKNQSIGL
IQPFATNGKL	FPWAQIRLPT	AVVPLRYELS	LHPNLTSMTF	RGSVTISVQA
LQVTWNIILH	STGHNISRVT	FMSAVSSQEK	QAEILEYAYH	GQIAIVAPEA
LLAGHNYTLK	IEYSANISSS	YYGFYGFSYT	DESNEKKYFA	ATQFEPLAAR
SAFPCFDEPA	FKATFIIKII	RDEQYTALSN	MPKKSSVVLD	DGLVQDEFSE
SVKMSTYLVA	FIVGEMKNLS	QDVNGTLVSI	YAVPEKIGQV	HYALETTVKL
LEFFQNYFEI	QYPLKKLDLV	AIPDFEAGAM	ENWGLLTFRE	ETLLYDSNTS
SMADRKLVTK	IIAHELAHQW	FGNLVTMKWW	NDLWLNEGFA	TFMEYFSLEK
IFKELSSYED	FLDARFKTMK	KDSLNSSHPI	SSSVQSSEQI	EEMFDSLSYF
KGSSLLLMLK	TYLSEDVFQH	AVVLYLHNHS	YASIQSDDLW	DSFNEVTNQT
LDVKRMMKTW	TLQKGFPLVT	VQKKGKELFI	QQERFFLNMK	PEIQPSDTSY
LWHIPLSYVT	EGRNYSKYQS	VSLLDKKSGV	INLTEEVLWV	KVNINMNGYY
IVHYADDDWE	ALIHQLKINP	YVLSDKDRAN	LINNIFELAG	LGKVPLKRAF
DLINYLGNEN	HTAPITEALF	QTDLIYNLLE	KLGYMDLASR	LVTRVFKLLQ
NQIQQQTWTD	EGTPSMRELR	SALLEFACTH	NLGNCSTTAM	KLFDDWMASN
GTQSLPTDVM	TTVFKVGAKT	DKGWSFLLGK	YISIGSEAEK	NKILEALASS
EDVRKLYWLM	KSSLNGDNFR	TQKLSFIIRT	VGRHFPGHLL	AWDFVKENWN
KLVQKFPLGS	YTIQNIVAGS	TYLFSTKTHL	SEVQAFFENQ	SEATFRLRCV
QEALEVIQLN	IQWMEKNLKS	LTWWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, амінопептидаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Rogi T., Tsujimoto M., Nakazato H., Mizutani S., Tomoda Y. (1996). Human placental leucine aminopeptidase/oxytocinase. A new member of type II membrane-spanning zinc metallopeptidase family. J. Biol. Chem. 271: 56—61. PMID 8550619 DOI:10.1074/jbc.271.1.56
Falk K., Roetzschke O., Stevanovic S., Jung G., Rammensee H.G. (1994). Pool sequencing of natural HLA-DR, DQ, and DP ligands reveals detailed peptide motifs, constraints of processing, and general rules. Immunogenetics. 39: 230—242. PMID 8119729 DOI:10.1007/BF00188785

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6656 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UIQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.