LOXL2

Ідентифікатори

Символи

LOXL2, LOR2, WS9-14, lysyl oxidase like 2, LOR

Зовнішні ІД

OMIM: 606663 MGI: 2137913 HomoloGene: 1742 GeneCards: LOXL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0015922 oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors, oxygen as acceptor • scavenger receptor activity • oligosaccharide binding • protein-lysine 6-oxidase activity • oxidoreductase activity • electron transfer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • copper ion binding • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • мембрана • хромосома • extracellular region • базальна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • Хроматин • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• positive regulation of chondrocyte differentiation • response to hypoxia • collagen fibril organization • Епітеліально-мезенхімальний перехід • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • endothelial cell migration • endothelial cell proliferation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to copper ion • адгезія клітин • GO:0010260 старіння людини • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • sprouting angiogenesis • transcription, DNA-templated • Електронтранспортний ланцюг • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • peptidyl-lysine oxidation • heterochromatin organization • negative regulation of stem cell population maintenance • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • vesicle-mediated transport • ендоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4017


94352

Ensembl


ENSG00000134013


ENSMUSG00000034205

UniProt


Q9Y4K0


P58022

RefSeq (мРНК)


NM_002318


NM_033325

RefSeq (білок)


NP_002309


NP_201582

Локус (UCSC)

Хр. 8: 23.3 – 23.43 Mb

Хр. 14: 69.85 – 69.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LOXL2 (англ. Lysyl oxidase like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 774 амінокислот, а молекулярна маса — 86 725^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERPLCSHLC	SCLAMLALLS	PLSLAQYDSW	PHYPEYFQQP	APEYHQPQAP
ANVAKIQLRL	AGQKRKHSEG	RVEVYYDGQW	GTVCDDDFSI	HAAHVVCREL
GYVEAKSWTA	SSSYGKGEGP	IWLDNLHCTG	NEATLAACTS	NGWGVTDCKH
TEDVGVVCSD	KRIPGFKFDN	SLINQIENLN	IQVEDIRIRA	ILSTYRKRTP
VMEGYVEVKE	GKTWKQICDK	HWTAKNSRVV	CGMFGFPGER	TYNTKVYKMF
ASRRKQRYWP	FSMDCTGTEA	HISSCKLGPQ	VSLDPMKNVT	CENGLPAVVS
CVPGQVFSPD	GPSRFRKAYK	PEQPLVRLRG	GAYIGEGRVE	VLKNGEWGTV
CDDKWDLVSA	SVVCRELGFG	SAKEAVTGSR	LGQGIGPIHL	NEIQCTGNEK
SIIDCKFNAE	SQGCNHEEDA	GVRCNTPAMG	LQKKLRLNGG	RNPYEGRVEV
LVERNGSLVW	GMVCGQNWGI	VEAMVVCRQL	GLGFASNAFQ	ETWYWHGDVN
SNKVVMSGVK	CSGTELSLAH	CRHDGEDVAC	PQGGVQYGAG	VACSETAPDL
VLNAEMVQQT	TYLEDRPMFM	LQCAMEENCL	SASAAQTDPT	TGYRRLLRFS
SQIHNNGQSD	FRPKNGRHAW	IWHDCHRHYH	SMEVFTHYDL	LNLNGTKVAE
GHKASFCLED	TECEGDIQKN	YECANFGDQG	ITMGCWDMYR	HDIDCQWVDI
TDVPPGDYLF	QVVINPNFEV	AESDYSNNIM	KCRSRYDGHR	IWMYNCHIGG
SFSEETEKKF	EHFSGLLNNQ	LSPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів. Локалізований у ядрі, позаклітинному матриксі, хромосомах, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Saito H., Papaconstantinou J., Sato H., Goldstein S. (1997). Regulation of a novel gene encoding a lysyl oxidase-related protein in cellular adhesion and senescence. J. Biol. Chem. 272: 8157—8160. PMID 9079631 DOI:10.1074/jbc.272.13.8157
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim Y.M., Kim E.C., Kim Y. (2011). The human lysyl oxidase-like 2 protein functions as an amine oxidase toward collagen and elastin. Mol. Biol. Rep. 38: 145—149. PMID 20306300 DOI:10.1007/s11033-010-0088-0

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6666 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y4K0 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.