LSM4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LSM4, GRP, YER112W, LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607284 MGI: 1354692 HomoloGene: 134555 GeneCards: LSM4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • U6 snRNA binding • RNA binding • PH domain binding |
---|
Клітинна компонента | • spliceosomal tri-snRNP complex • U6 snRNP • P-body • нуклеоплазма • neuron projection • spliceosomal complex • клітинне ядро • гіалоплазма • мембрана • GO:0009327 protein-containing complex • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome • Lsm2-8 complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • spliceosomal complex assembly • P-body assembly • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • nuclear-transcribed mRNA catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3e/PBB_GE_LSM4_202736_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LSM4_202736_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/50/PBB_GE_LSM4_202737_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_LSM4_202737_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.31 – 18.32 Mb | Хр. 8: 71.13 – 71.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LSM4 (англ. LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 139 амінокислот, а молекулярна маса — 15 350[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLPLSLLKTA | | QNHPMLVELK | | NGETYNGHLV | | SCDNWMNINL | | REVICTSRDG |
DKFWRMPECY | | IRGSTIKYLR | | IPDEIIDMVK | | EEVVAKGRGR | | GGLQQQKQQK |
GRGMGGAGRG | | VFGGRGRGGI | | PGTGRGQPEK | | KPGRQAGKQ |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Salgado-Garrido J., Bragado-Nilsson E., Kandels-Lewis S., Seraphin B. (1999). Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin. EMBO J. 18: 3451—3462. PMID 10369684 DOI:10.1093/emboj/18.12.3451
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17259 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4Z0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |