LUC7L3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | LUC7L3, CRA, CREAP-1, CROP, LUC7A, OA48-18, hLuc7A, LUC7 like 3 pre-mRNA splicing factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609434 MGI: 1914934 HomoloGene: 75056 GeneCards: LUC7L3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • U1 snRNP • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • mRNA splice site selection • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_006107 NM_016424 NM_001330330 |
| | NM_026313 NM_001361573 NM_001361574 NM_001361575 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001317259 NP_006098 NP_057508 |
| | NP_080589 NP_001348502 NP_001348503 NP_001348504 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 50.72 – 50.76 Mb | Хр. 11: 94.18 – 94.21 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LUC7L3 (англ. LUC7 like 3 pre-mRNA splicing factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 432 амінокислот, а молекулярна маса — 51 466[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MISAAQLLDE | | LMGRDRNLAP | | DEKRSNVRWD | | HESVCKYYLC | | GFCPAELFTN |
TRSDLGPCEK | | IHDENLRKQY | | EKSSRFMKVG | | YERDFLRYLQ | | SLLAEVERRI |
RRGHARLALS | | QNQQSSGAAG | | PTGKNEEKIQ | | VLTDKIDVLL | | QQIEELGSEG |
KVEEAQGMMK | | LVEQLKEERE | | LLRSTTSTIE | | SFAAQEKQME | | VCEVCGAFLI |
VGDAQSRVDD | | HLMGKQHMGY | | AKIKATVEEL | | KEKLRKRTEE | | PDRDERLKKE |
KQEREEREKE | | REREREERER | | KRRREEEERE | | KERARDRERR | | KRSRSRSRHS |
SRTSDRRCSR | | SRDHKRSRSR | | ERRRSRSRDR | | RRSRSHDRSE | | RKHRSRSRDR |
RRSKSRDRKS | | YKHRSKSRDR | | EQDRKSKEKE | | KRGSDDKKSS | | VKSGSREKQS |
EDTNTESKES | | DTKNEVNGTS | | EDIKSEGDTQ | | SN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Shipman K.L., Robinson P.J., King B.R., Smith R., Nicholson R.C. (2006). Identification of a family of DNA-binding proteins with homology to RNA splicing factors. Biochem. Cell Biol. 84: 9—19. PMID 16462885 DOI:10.1139/o05-139
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chin L.S., Singh S.K., Wang Q., Murray S.F. (2000). Identification of okadaic-acid-induced genes by mRNA differential display in glioma cells. J. Biomed. Sci. 7: 152—159. PMID 10754390 DOI:10.1007/BF02256622
- Cazalla D., Newton K., Caceres J.F. (2005). A novel SR-related protein is required for the second step of pre-mRNA splicing. Mol. Cell. Biol. 25: 2969—2980. PMID 15798186 DOI:10.1128/MCB.25.8.2969-2980.2005
- Zhou A., Ou A.C., Cho A., Benz E.J. Jr., Huang S.C. (2008). Novel splicing factor RBM25 modulates Bcl-x pre-mRNA 5' splice site selection. Mol. Cell. Biol. 28: 5924—5936. PMID 18663000 DOI:10.1128/MCB.00560-08
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24309 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95232 (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |