MAP1S

Ідентифікатори

Символи

MAP1S, BPY2IP1, C19orf5, MAP8, VCY2IP-1, VCY2IP1, microtubule associated protein 1S

Зовнішні ІД

OMIM: 607573 MGI: 2443304 HomoloGene: 10047 GeneCards: MAP1S

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • deoxyribonuclease activity • microtubule binding • tubulin binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • identical protein binding • actin binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • cell projection • microtubule cytoskeleton • веретено поділу • синапс • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • microtubule associated complex
Біологічний процес	• neuron projection morphogenesis • нейробіологія розвитку • автофагія • brain development • microtubule bundle formation • mitochondrion transport along microtubule • microtubule cytoskeleton organization • GO:0097285 апоптоз • DNA metabolic process • аксоноґенеза • dendrite development • regulation of microtubule depolymerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55201


270058

Ensembl


ENSG00000130479


ENSMUSG00000019261

UniProt


Q66K74


Q8C052

RefSeq (мРНК)


NM_001308363 NM_018174


NM_173013

RefSeq (білок)


NP_001295292 NP_060644


NP_766601

Локус (UCSC)

Хр. 19: 17.72 – 17.73 Mb

Хр. 8: 71.36 – 71.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MAP1S (англ. Microtubule associated protein 1S) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 059 амінокислот, а молекулярна маса — 112 211^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVAGSGAA	AAPSSLLLVV	GSEFGSPGLL	TYVLEELERG	IRSWDVDPGV
CNLDEQLKVF	VSRHSATFSS	IVKGQRSLHH	RGDNLETLVL	LNPSDKSLYD
ELRNLLLDPA	SHKLLVLAGP	CLEETGELLL	QTGGFSPHHF	LQVLKDREIR
DILATTPPPV	QPPILTITCP	TFGDWAQLAP	AVPGLQGALR	LQLRLNPPAQ
LPNSEGLCEF	LEYVAESLEP	PSPFELLEPP	TSGGFLRLGR	PCCYIFPGGL
GDAAFFAVNG	FTVLVNGGSN	PKSSFWKLVR	HLDRVDAVLV	THPGADSLPG
LNSLLRRKLA	ERSEVAAGGG	SWDDRLRRLI	SPNLGVVFFN	ACEAASRLAR
GEDEAELALS	LLAQLGITPL	PLSRGPVPAK	PTVLFEKMGV	GRLDMYVLHP
PSAGAERTLA	SVCALLVWHP	AGPGEKVVRV	LFPGCTPPAC	LLDGLVRLQH
LRFLREPVVT	PQDLEGPGRA	ESKESVGSRD	SSKREGLLAT	HPRPGQERPG
VARKEPARAE	APRKTEKEAK	TPRELKKDPK	PSVSRTQPRE	VRRAASSVPN
LKKTNAQAAP	KPRKAPSTSH	SGFPPVANGP	RSPPSLRCGE	ASPPSAACGS
PASQLVATPS	LELGPIPAGE	EKALELPLAA	SSIPRPRTPS	PESHRSPAEG
SERLSLSPLR	GGEAGPDASP	TVTTPTVTTP	SLPAEVGSPH	STEVDESLSV
SFEQVLPPSA	PTSEAGLSLP	LRGPRARRSA	SPHDVDLCLV	SPCEFEHRKA
VPMAPAPASP	GSSNDSSARS	QERAGGLGAE	ETPPTSVSES	LPTLSDSDPV
PLAPGAADSD	EDTEGFGVPR	HDPLPDPLKV	PPPLPDPSSI	CMVDPEMLPP
KTARQTENVS	RTRKPLARPN	SRAAAPKATP	VAAAKTKGLA	GGDRASRPLS
ARSEPSEKGG	RAPLSRKSST	PKTATRGPSG	SASSRPGVSA	TPPKSPVYLD
LAYLPSGSSA	HLVDEEFFQR	VRALCYVISG	QDQRKEEGMR	AVLDALLASK
QHWDRDLQVT	LIPTFDSVAM	HTWYAETHAR	HQALGITVLG	SNSMVSMQDD
AFPACKVEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu L., McKeehan W.L. (2002). Sequence analysis of LRPPRC and its SEC1 domain interaction partners suggests roles in cytoskeletal organization, vesicular trafficking, nucleocytosolic shuttling, and chromosome activity. Genomics. 79: 124—136. PMID 11827465 DOI:10.1006/geno.2001.6679
Liu L., Amy V., Liu G., McKeehan W.L. (2002). Novel complex integrating mitochondria and the microtubular cytoskeleton with chromosome remodeling and tumor suppressor RASSF1 deduced by in silico homology analysis, interaction cloning in yeast, and colocalization in cultured cells. In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 38: 582—594. PMID 12762840 DOI:10.1290/1543-706X(2002)38<582:NCIMAT>2.0.CO;2
Liu L., Vo A., Liu G., McKeehan W.L. (2005). Putative tumor suppressor RASSF1 interactive protein and cell death inducer C19ORF5 is a DNA binding protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332: 670—676. PMID 15907802 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.05.006
Liu L., Vo A., McKeehan W.L. (2005). Specificity of the methylation-suppressed A isoform of candidate tumor suppressor RASSF1 for microtubule hyperstabilization is determined by cell death inducer C19ORF5. Cancer Res. 65: 1830—1838. PMID 15753381 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-3896
Liu L., Vo A., Liu G., McKeehan W.L. (2005). Distinct structural domains within C19ORF5 support association with stabilized microtubules and mitochondrial aggregation and genome destruction. Cancer Res. 65: 4191—4201. PMID 15899810 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-3865

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15715 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q66K74 (англ.) . Архів оригіналу за 15 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.