MARF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DGX, 2DIU

Ідентифікатори

Символи

MARF1, LKAP, PPP1R34, KIAA0430, LMKB, meiosis regulator and mRNA stability factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 614593 MGI: 2444505 HomoloGene: 40967 GeneCards: MARF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • nucleic acid binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• пероксисома • мембрана • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• negative regulation of phosphatase activity • регуляція експресії генів • диференціація клітин • GO:0007126 мейоз • female meiotic nuclear division • double-strand break repair • Оогенез
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9665


223989

Ensembl


ENSG00000166783 ENSG00000277140


ENSMUSG00000060657

UniProt


Q9Y4F3


Q8BJ34

RefSeq (мРНК)


NM_001184998 NM_001184999 NM_014647 NM_019081


NM_001081154

RefSeq (білок)


NP_001171927 NP_001171928 NP_055462


NP_001074623

Локус (UCSC)

Хр. 16: 15.59 – 15.64 Mb

Хр. 16: 13.93 – 13.98 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MARF1 (англ. Meiosis regulator and mRNA stability factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 742 амінокислот, а молекулярна маса — 192 859^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMEGNGTENS	CSRTRGWLQQ	DNDAKPWLWK	FSNCFSRPEQ	TLPHSPQTKE
YMENKKVAVE	LKDVPSPLHA	GSKLFPAVPL	PDIRSLQQPK	IQLSSVPKVS
CCAHCPNEPS	TSPMRFGGGG	GGSGGTSSLI	HPGALLDSQS	TRTITCQVGS
GFAFQSASSL	QNASARNNLA	GIASDFPSMC	LESNLSSCKH	LPCCGKLHFQ
SCHGNVHKLH	QFPSLQGCTS	AGYFPCSDFT	SGAPGHLEEH	ISQSELTPHL
CTNSLHLNVV	PPVCLKGSLY	CEDCLNKPAR	NSIIDAAKVW	PNIPPPNTQP
APLAVPLCNG	CGTKGTGKET	TLLLATSLGK	AASKFGSPEV	AVAGQVLENL
PPIGVFWDIE	NCSVPSGRSA	TAVVQRIREK	FFKGHREAEF	ICVCDISKEN
KEVIQELNNC	QVTVAHINAT	AKNAADDKLR	QSLRRFANTH	TAPATVVLVS
TDVNFALELS	DLRHRHGFHI	ILVHKNQASE	ALLHHANELI	RFEEFISDLP
PRLPLKMPQC	HTLLYVYNLP	ANKDGKSVSN	RLRRLSDNCG	GKVLSITGCS
AILRFINQDS	AERAQKRMEN	EDVFGNRIIV	SFTPKNRELC	ETKSSNAIAD
KVKSPKKLKN	PKLCLIKDAS	EQSSSAKATP	GKGSQANSGS	ATKNTNVKSL
QELCRMESKT	GHRNSEHQQG	HLRLVVPTHG	NSSAAVSTPK	NSGVAEPVYK
TSQKKENLSA	RSVTSSPVEK	KDKEETVFQV	SYPSAFSKLV	ASRQVSPLLA
SQSWSSRSMS	PNLLNRASPL	AFNIANSSSE	ADCPDPFANG	ADVQVSNIDY
RLSRKELQQL	LQEAFARHGK	VKSVELSPHT	DYQLKAVVQM	ENLQDAIGAV
NSLHRYKIGS	KKILVSLATG	AASKSLSLLS	AETMSVLQDA	PACCLPLFKF
TDIYEKKFGH	KLNVSDLYKL	TDTVAIREQG	NGRLVCLLPS	SQARQSPLGS
SQSHDGSSTN	CSPIIFEELE	YHEPVCRQHC	SNKDFSEHEF	DPDSYKIPFV
ILSLKTFAPQ	VHSLLQTHEG	TVPLLSFPDC	YIAEFGDLEV	VQENQGGVPL
EHFITCVPGV	NIATAQNGIK	VVKWIHNKPP	PPNTDPWLLR	SKSPVGNPQL
IQFSREVIDL	LKSQPSCVIP	ISHFIPSYHH	HFAKQCRVSD	YGYSKLIELL
EAVPHVLQIL	GMGSKRLLTL	THRAQVKRFT	QDLLKLLKSQ	ASKQVIVREF
SQAYHWCFSK	DWDVTEYGVC	ELIDIVSEIP	DTTICLSQQD	NEMVICIPKR
ERTQDEIERT	KQFSKDVVDL	LRHQPHFRMP	FNKFIPSYHH	HFGRQCKLAY
YGFTKLLELF	EAIPDTLQVL	ECGEEKILTL	TEVERFKALA	AQFVKLLRSQ
KDNCLMMTDL	LTEYAKTFGY	TFRLQDYDVS	SISALTQKLC	HVVKVADIES
GRQIQLINRK	SLRSLTAQLL	VLLMSWEGTT	HLSVEELKRH	YESTHNTPLN
PCEYGFMTLT	ELLKSLPYLV	EVFTNDKMEE	CVKLTSLYLF	AKNVRSLLHT
YHYQQIFLHE	FSMAYTKYVG	ETLQPKTYGH	SSVEELLGAI	PQVVWIKGHG
HKRIVVLKND	MKSRLSSLSL	SPANHENQPS	EGERILEVPE	SHTASELKLG
ADGSGPSHTE	QELLRLTDDS	PVDLLCAPVP	SCLPSPQLRP	DPVILQSADL
IQFEERPQEP	SEIMILNQEE	KMEIPIPGKS	KTLTSDSSSS	CISAAVPVPP
CPSSETSESL	LSKDPVESPA	KKQPKNRVKL	AANFSLAPIT	KL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у пероксисомах.

Література

Dunster K., Lai F.P.L., Sentry J.W. (2005). Limkain b1, a novel human autoantigen localized to a subset of ABCD3 and PXF marked peroxisomes. Clin. Exp. Immunol. 140: 556—563. PMID 15932519 DOI:10.1111/j.1365-2249.2005.02774.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29562 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4F3 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.