MED13

Ідентифікатори

Символи

MED13, ARC250, DRIP250, HSPC221, THRAP1, TRAP240, mediator complex subunit 13, MRD61

Зовнішні ІД

OMIM: 603808 MGI: 3029632 HomoloGene: 21067 GeneCards: MED13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • thyroid hormone receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • vitamin D receptor binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• мембрана • mediator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• androgen receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cholesterol homeostasis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • triglyceride homeostasis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9969


327987

Ensembl


ENSG00000108510


ENSMUSG00000034297

UniProt


Q9UHV7


Q5SWW4

RefSeq (мРНК)


NM_005121


NM_001080931

RefSeq (білок)


NP_005112


NP_001074400

Локус (UCSC)

Хр. 17: 61.94 – 62.07 Mb

Хр. 11: 86.16 – 86.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MED13 (англ. Mediator complex subunit 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 174 амінокислот, а молекулярна маса — 239 297^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSASFVPNGA	SLEDCHCNLF	CLADLTGIKW	KKYVWQGPTS	APILFPVTEE
DPILSSFSRC	LKADVLGVWR	RDQRPGRREL	WIFWWGEDPS	FADLIHHDLS
EEEDGVWENG	LSYECRTLLF	KAVHNLLERC	LMNRNFVRIG	KWFVKPYEKD
EKPINKSEHL	SCSFTFFLHG	DSNVCTSVEI	NQHQPVYLLS	EEHITLAQQS
NSPFQVILCP	FGLNGTLTGQ	AFKMSDSATK	KLIGEWKQFY	PISCCLKEMS
EEKQEDMDWE	DDSLAAVEVL	VAGVRMIYPA	CFVLVPQSDI	PTPSPVGSTH
CSSSCLGVHQ	VPASTRDPAM	SSVTLTPPTS	PEEVQTVDPQ	SVQKWVKFSS
VSDGFNSDST	SHHGGKIPRK	LANHVVDRVW	QECNMNRAQN	KRKYSASSGG
LCEEATAAKV	ASWDFVEATQ	RTNCSCLRHK	NLKSRNAGQQ	GQAPSLGQQQ
QILPKHKTNE	KQEKSEKPQK	RPLTPFHHRV	SVSDDVGMDA	DSASQRLVIS
APDSQVRFSN	IRTNDVAKTP	QMHGTEMANS	PQPPPLSPHP	CDVVDEGVTK
TPSTPQSQHF	YQMPTPDPLV	PSKPMEDRID	SLSQSFPPQY	QEAVEPTVYV
GTAVNLEEDE	ANIAWKYYKF	PKKKDVEFLP	PQLPSDKFKD	DPVGPFGQES
VTSVTELMVQ	CKKPLKVSDE	LVQQYQIKNQ	CLSAIASDAE	QEPKIDPYAF
VEGDEEFLFP	DKKDRQNSER	EAGKKHKVED	GTSSVTVLSH	EEDAMSLFSP
SIKQDAPRPT	SHARPPSTSL	IYDSDLAVSY	TDLDNLFNSD	EDELTPGSKK
SANGSDDKAS	CKESKTGNLD	PLSCISTADL	HKMYPTPPSL	EQHIMGFSPM
NMNNKEYGSM	DTTPGGTVLE	GNSSSIGAQF	KIEVDEGFCS	PKPSEIKDFS
YVYKPENCQI	LVGCSMFAPL	KTLPSQYLPP	IKLPEECIYR	QSWTVGKLEL
LSSGPSMPFI	KEGDGSNMDQ	EYGTAYTPQT	HTSFGMPPSS	APPSNSGAGI
LPSPSTPRFP	TPRTPRTPRT	PRGAGGPASA	QGSVKYENSD	LYSPASTPST
CRPLNSVEPA	TVPSIPEAHS	LYVNLILSES	VMNLFKDCNF	DSCCICVCNM
NIKGADVGVY	IPDPTQEAQY	RCTCGFSAVM	NRKFGNNSGL	FLEDELDIIG
RNTDCGKEAE	KRFEALRATS	AEHVNGGLKE	SEKLSDDLIL	LLQDQCTNLF
SPFGAADQDP	FPKSGVISNW	VRVEERDCCN	DCYLALEHGR	QFMDNMSGGK
VDEALVKSSC	LHPWSKRNDV	SMQCSQDILR	MLLSLQPVLQ	DAIQKKRTVR
PWGVQGPLTW	QQFHKMAGRG	SYGTDESPEP	LPIPTFLLGY	DYDYLVLSPF
ALPYWERLML	EPYGSQRDIA	YVVLCPENEA	LLNGAKSFFR	DLTAIYESCR
LGQHRPVSRL	LTDGIMRVGS	TASKKLSEKL	VAEWFSQAAD	GNNEAFSKLK
LYAQVCRYDL	GPYLASLPLD	SSLLSQPNLV	APTSQSLITP	PQMTNTGNAN
TPSATLASAA	SSTMTVTSGV	AISTSVATAN	STLTTASTSS	SSSSNLNSGV
SSNKLPSFPP	FGSMNSNAAG	SMSTQANTVQ	SGQLGGQQTS	ALQTAGISGE
SSSLPTQPHP	DVSESTMDRD	KVGIPTDGDS	HAVTYPPAIV	VYIIDPFTYE
NTDESTNSSS	VWTLGLLRCF	LEMVQTLPPH	IKSTVSVQII	PCQYLLQPVK
HEDREIYPQH	LKSLAFSAFT	QCRRPLPTST	NVKTLTGFGP	GLAMETALRS
PDRPECIRLY	APPFILAPVK	DKQTELGETF	GEAGQKYNVL	FVGYCLSHDQ
RWILASCTDL	YGELLETCII	NIDVPNRARR	KKSSARKFGL	QKLWEWCLGL
VQMSSLPWRV	VIGRLGRIGH	GELKDWSCLL	SRRNLQSLSK	RLKDMCRMCG
ISAADSPSIL	SACLVAMEPQ	GSFVIMPDSV	STGSVFGRST	TLNMQTSQLN
TPQDTSCTHI	LVFPTSASVQ	VASATYTTEN	LDLAFNPNND	GADGMGIFDL
LDTGDDLDPD	IINILPASPT	GSPVHSPGSH	YPHGGDAGKG	QSTDRLLSTE
PHEEVPNILQ	QPLALGYFVS	TAKAGPLPDW	FWSACPQAQY	QCPLFLKASL
HLHVPSVQSD	ELLHSKHSHP	LDSNQTSDVL	RFVLEQYNAL	SWLTCDPATQ
DRRSCLPIHF	VVLNQLYNFI	MNML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Baek H.J., Kang Y.K., Roeder R.G. (2006). Human Mediator enhances basal transcription by facilitating recruitment of transcription factor IIB during preinitiation complex assembly. J. Biol. Chem. 281: 15172—15181. PMID 16595664 DOI:10.1074/jbc.M601983200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UHV7 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.