MFGE8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2L9L

Ідентифікатори

Символи

MFGE8, milk fat globule-EGF factor 8 protein, BA46, EDIL1, HMFG, HsT19888, MFG-E8, MFGM, OAcGD3S, SED1, SPAG10, hP47, milk fat globule EGF and factor V/VIII domain containing

Зовнішні ІД

OMIM: 602281 MGI: 102768 HomoloGene: 4334 GeneCards: MFGE8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylserine binding • phosphatidylethanolamine binding • integrin binding • extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• external side of plasma membrane • extrinsic component of plasma membrane • extracellular region • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular vesicle • мембрана • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• phagocytosis, recognition • Ангіогенез • positive regulation of phagocytosis • positive regulation of apoptotic cell clearance • phagocytosis, engulfment • адгезія клітин • single fertilization • GO:0022415 viral process • посттрансляційна модифікація • apoptotic cell clearance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4240


17304

Ensembl


ENSG00000140545


ENSMUSG00000030605

UniProt


Q08431


P21956

RefSeq (мРНК)


NM_001114614 NM_001310319 NM_001310320 NM_001310321 NM_005928


NM_001045489 NM_008594

RefSeq (білок)


NP_001108086 NP_001297248 NP_001297249 NP_001297250 NP_005919


NP_001038954 NP_032620

Локус (UCSC)

Хр. 15: 88.9 – 88.91 Mb

Хр. 7: 78.78 – 78.8 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MFGE8 (англ. Milk fat globule-EGF factor 8 protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 43 123^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRPRLLAAL	CGALLCAPSL	LVALDICSKN	PCHNGGLCEE	ISQEVRGDVF
PSYTCTCLKG	YAGNHCETKC	VEPLGMENGN	IANSQIAASS	VRVTFLGLQH
WVPELARLNR	AGMVNAWTPS	SNDDNPWIQV	NLLRRMWVTG	VVTQGASRLA
SHEYLKAFKV	AYSLNGHEFD	FIHDVNKKHK	EFVGNWNKNA	VHVNLFETPV
EAQYVRLYPT	SCHTACTLRF	ELLGCELNGC	ANPLGLKNNS	IPDKQITASS
SYKTWGLHLF	SWNPSYARLD	KQGNFNAWVA	GSYGNDQWLQ	VDLGSSKEVT
GIITQGARNF	GSVQFVASYK	VAYSNDSANW	TEYQDPRTGS	SKIFPGNWDN
HSHKKNLFET	PILARYVRIL	PVAWHNRIAL	RLELLGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, запліднення, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Couto J.R., Taylor M.R., Godwin S.G., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1996). Cloning and sequence analysis of human breast epithelial antigen BA46 reveals an RGD cell adhesion sequence presented on an epidermal growth factor-like domain. DNA Cell Biol. 15: 281—286. PMID 8639264 DOI:10.1089/dna.1996.15.281
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Giuffrida M.G., Cavaletto M., Giunta C., Conti A., Godovac-Zimmermann J. (1998). Isolation and characterization of full and truncated forms of human breast carcinoma protein BA46 from human milk fat globule membranes. J. Protein Chem. 17: 143—148. PMID 9535276 DOI:10.1023/A:1022531500370
Taylor M.R., Couto J.R., Scallan C.D., Ceriani R.L., Peterson J.A. (1997). Lactadherin (formerly BA46), a membrane-associated glycoprotein expressed in human milk and breast carcinomas, promotes Arg-Gly-Asp (RGD)-dependent cell adhesion. DNA Cell Biol. 16: 861—869. PMID 9260929 DOI:10.1089/dna.1997.16.861
Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
Raymond A., Ensslin M.A., Shur B.D. (2009). SED1/MFG-E8: a bi-motif protein that orchestrates diverse cellular interactions. J. Cell. Biochem. 106: 957—966. PMID 19204935 DOI:10.1002/jcb.22076

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7036 (англ.) . Архів оригіналу за 27 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q08431 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.