MMP20

MMP20
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2JSD

Ідентифікатори
Символи MMP20, AI2A2, MMP-20, matrix metallopeptidase 20
Зовнішні ІД OMIM: 604629 MGI: 1353466 HomoloGene: 21001 GeneCards: MMP20
Пов'язані генетичні захворювання
amelogenesis imperfecta hypomaturation type 2A2, hypomaturation amelogenesis imperfecta[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

zinc ion binding
GO:0070122 peptidase activity
metalloendopeptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
hydrolase activity
metallopeptidase activity
зв'язування з іоном металу
serine-type endopeptidase activity

Клітинна компонента

GO:0005578 Позаклітинна матриця
extracellular region
міжклітинний простір

Біологічний процес

collagen catabolic process
GO:0044257 protein catabolic process
regulation of enamel mineralization
протеоліз
amelogenesis
extracellular matrix disassembly
extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9313
30800
Ensembl
ENSG00000137674
ENSMUSG00000018620
UniProt
O60882
P57748
RefSeq (мРНК)
NM_004771
NM_013903
RefSeq (білок)
NP_004762
NP_038931
Локус (UCSC) Хр. 11: 102.58 – 102.63 Mb Хр. 9: 7.63 – 7.67 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP20 (англ. Matrix metallopeptidase 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 54 387[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKVLPASGLAVFLIMALKFSTAAPSLVAASPRTWRNNYRLAQAYLDKYYT
NKEGHQIGEMVARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRC
GVPDVANYRLFPGEPKWKKNTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWS
SAVPLSFVRINSGEADIMISFENGDHGDSYPFDGPRGTLAHAFAPGEGLG
GDTHFDNAEKWTMGTNGFNLFTVAAHEFGHALGLAHSTDPSALMYPTYKY
KNPYGFHLPKDDVKGIQALYGPRKVFLGKPTLPHAPHHKPSIPDLCDSSS
SFDAVTMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSFPQLMSNVDAA
YEVAERGTAYFFKGPHYWITRGFQMQGPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYL
REPQKTLFFVGDEYYSYDERKRKMEKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAVELN
GYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVVSVVKSSSWIGC

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з MMP20 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7167 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, O60882 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.