MYBBP1A

Ідентифікатори

Символи

MYBBP1A, P160, PAP2, MYB binding protein 1a, Pol5

Зовнішні ІД

OMIM: 604885 MGI: 106181 HomoloGene: 40954 GeneCards: MYBBP1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA-directed DNA polymerase activity • RNA binding • E-box binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • нуклеоплазма • NLS-dependent protein nuclear import complex • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес	• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • cellular response to glucose starvation • DNA biosynthetic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • nucleocytoplasmic transport • osteoblast differentiation • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of anoikis • respiratory electron transport chain • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • ribosome biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10514


18432

Ensembl


ENSG00000132382


ENSMUSG00000040463

UniProt


Q9BQG0


Q7TPV4

RefSeq (мРНК)


NM_001105538 NM_014520


NM_016776

RefSeq (білок)


NP_001099008 NP_055335


NP_058056

Локус (UCSC)

Хр. 17: 4.54 – 4.56 Mb

Хр. 11: 72.33 – 72.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MYBBP1A (англ. MYB binding protein 1a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 328 амінокислот, а молекулярна маса — 148 855^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESRDPAQPM	SPGEATQSGA	RPADRYGLLK	HSREFLDFFW	DIAKPEQETR
LAATEKLLEY	LRGRPKGSEM	KYALKRLITG	LGVGRETARP	CYSLALAQLL
QSFEDLPLCS	ILQQIQEKYD	LHQVKKAMLR	PALFANLFGV	LALFQSGRLV
KDQEALMKSV	KLLQALAQYQ	NHLQEQPRKA	LVDILSEVSK	ATLQEILPEV
LKADLNIILS	SPEQLELFLL	AQQKVPSKLK	KLVGSVNLFS	DENVPRLVNV
LKMAASSVKK	DRKLPAIALD	LLRLALKEDK	FPRFWKEVVE	QGLLKMQFWP
ASYLCFRLLG	AALPLLTKEQ	LHLVMQGDVI	RHYGEHVCTA	KLPKQFKFAP
EMDDYVGTFL	EGCQDDPERQ	LAVLVAFSSV	TNQGLPVTPT	FWRVVRFLSP
PALQGYVAWL	RAMFLQPDLD	SLVDFSTNNQ	KKAQDSSLHM	PERAVFRLRK
WIIFRLVSIV	DSLHLEMEEA	LTEQVARFCL	FHSFFVTKKP	TSQIPETKHP
FSFPLENQAR	EAVSSAFFSL	LQTLSTQFKQ	APGQTQGGQP	WTYHLVQFAD
LLLNHSHNVT	TVTPFTAQQR	QAWDRMLQTL	KELEAHSAEA	RAAAFQHLLL
LVGIHLLKSP	AESCDLLGDI	QTCIRKSLGE	KPRRSRTKTI	DPQEPPWVEV
LVEILLALLA	QPSHLMRQVA	RSVFGHICSH	LTPRALQLIL	DVLNPETSED
ENDRVVVTDD	SDERRLKGAE	DKSEEGEDNR	SSESEEESEG	EESEEEERDG
DVDQGFREQL	MTVLQAGKAL	GGEDSENEEE	LGDEAMMALD	QSLASLFAEQ
KLRIQARRDE	KNKLQKEKAL	RRDFQIRVLD	LVEVLVTKQP	ENALVLELLE
PLLSIIRRSL	RSSSSKQEQD	LLHKTARIFT	HHLCRARRYC	HDLGERAGAL
HAQVERLVQQ	AGRQPDSPTA	LYHFNASLYL	LRVLKGNTAE	GCVHETQEKQ
KAGTDPSHMP	TGPQAASCLD	LNLVTRVYST	ALSSFLTKRN	SPLTVPMFLS
LFSRHPVLCQ	SLLPILVQHI	TGPVRPRHQA	CLLLQKTLSM	REVRSCFEDP
EWKQLMGQVL	AKVTENLRVL	GEAQTKAQHQ	QALSSLELLN	VLFRTCKHEK
LTLDLTVLLG	VLQGQQQSLQ	QGAHSTGSSR	LHDLYWQAMK	TLGVQRPKLE
KKDAKEIPSA	TQSPISKKRK	KKGFLPETKK	RKKRKSEDGT	PAEDGTPAAT
GGSQPPSMGR	KKRNRTKAKV	PAQANGTPTT	KSPAPGAPTR	SPSTPAKSPK
LQKKNQKPSQ	VNGAPGSPTE	PAGQKQHQKA	LPKKGVLGKS	PLSALARKKA
RLSLVIRSPS	LLQSGAKKKA	QVRKAGKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7546 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BQG0 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.