NCS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4GUK, 1G8I, 2LCP, 5AER, 5AFP, 5AEQ

Ідентифікатори

Символи

NCS1, FLUP, FREQ, neuronal calcium sensor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603315 MGI: 109166 HomoloGene: 5719 GeneCards: NCS1

Пов'язані генетичні захворювання

хвороба Альцгеймера^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • protein kinase binding • voltage-gated calcium channel activity involved in regulation of presynaptic cytosolic calcium levels
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • синапс • аксон • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • perinuclear region of cytoplasm • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • calyx of Held • postsynapse • glutamatergic synapse • presynaptic cytosol • postsynaptic cytosol
Біологічний процес	• regulation of neuron projection development • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of exocytosis • phosphatidylinositol-mediated signaling • regulation of synaptic vesicle exocytosis • regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23413


14299

Ensembl


ENSG00000107130


ENSMUSG00000062661

UniProt


P62166


Q8BNY6

RefSeq (мРНК)


NM_014286 NM_001128826


NM_019681

RefSeq (білок)


NP_001122298 NP_055101


NP_062655

Локус (UCSC)

Хр. 9: 130.17 – 130.24 Mb

Хр. 2: 31.14 – 31.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NCS1 (англ. Neuronal calcium sensor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 879^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKSNSKLKP	EVVEELTRKT	YFTEKEVQQW	YKGFIKDCPS	GQLDAAGFQK
IYKQFFPFGD	PTKFATFVFN	VFDENKDGRI	EFSEFIQALS	VTSRGTLDEK
LRWAFKLYDL	DNDGYITRNE	MLDIVDAIYQ	MVGNTVELPE	EENTPEKRVD
RIFAMMDKNA	DGKLTLQEFQ	EGSKADPSIV	QALSLYDGLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Haynes L.P., Sherwood M.W., Dolman N.J., Burgoyne R.D. (2007). Specificity, promiscuity and localization of ARF protein interactions with NCS-1 and phosphatidylinositol-4 kinase-III beta. Traffic. 8: 1080—1092. PMID 17555535 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00594.x
Bourne Y., Dannenberg J., Pollmann V., Marchot P., Pongs O. (2001). Immunocytochemical localization and crystal structure of human frequenin (neuronal calcium sensor 1). J. Biol. Chem. 276: 11949—11955. PMID 11092894 DOI:10.1074/jbc.M009373200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NCS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3953 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P62166 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.