NDEL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2V66

Ідентифікатори

Символи

NDEL1, EOPA, MITAP1, NDE1L1, NDE2, NUDEL, nudE neurodevelopment protein 1 like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607538 MGI: 1932915 HomoloGene: 32567 GeneCards: NDEL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• alpha-tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • oligopeptidase activity • microtubule binding • identical protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell body • neurofilament cytoskeleton • nuclear envelope • Синаптичні бульбашки • веретено поділу • хромосома • центр організації мікротрубочок • microtubule associated complex • аксон • cell leading edge • аксонний горбик • мікротрубочка • центромера • цитоскелет • кінетохор • axon cytoplasm • гіалоплазма • central region of growth cone • центросома • Кінезин
Біологічний процес	• retrograde axonal transport • диференціація клітин • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • chromosome segregation • neuron migration • positive regulation of axon regeneration • нейробіологія розвитку • протеоліз • neuron projection extension • inner cell mass cell proliferation • multicellular organism development • regulation of intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • nuclear membrane disassembly • positive regulation of axon extension • neurofilament cytoskeleton organization • cerebral cortex radially oriented cell migration • neuron projection development • microtubule cytoskeleton organization • central nervous system neuron axonogenesis • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • establishment of mitotic spindle orientation • Нуклеація елементів цитоскелету • mitotic centrosome separation • regulation of neuron projection development • cell migration • vesicle transport along microtubule • establishment of chromosome localization • centrosome localization • lysosome localization • positive regulation of ruffle assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81565


83431

Ensembl


ENSG00000166579


ENSMUSG00000018736

UniProt


Q9GZM8


Q9ERR1

RefSeq (мРНК)


NM_001025579 NM_030808 NM_001330129


NM_023668 NM_001363304 NM_001363305

RefSeq (білок)


NP_001020750 NP_001317058 NP_110435


NP_076157 NP_001350233 NP_001350234

Локус (UCSC)

Хр. 17: 8.41 – 8.49 Mb

Хр. 11: 68.71 – 68.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NDEL1 (англ. NudE neurodevelopment protein 1 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 38 375^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDGEDIPDFS	SLKEETAYWK	ELSLKYKQSF	QEARDELVEF	QEGSRELEAE
LEAQLVQAEQ	RNRDLQADNQ	RLKYEVEALK	EKLEHQYAQS	YKQVSVLEDD
LSQTRAIKEQ	LHKYVRELEQ	ANDDLERAKR	ATIVSLEDFE	QRLNQAIERN
AFLESELDEK	ESLLVSVQRL	KDEARDLRQE	LAVRERQQEV	TRKSAPSSPT
LDCEKMDSAV	QASLSLPATP	VGKGTENTFP	SPKAIPNGFG	TSPLTPSARI
SALNIVGDLL	RKVGALESKL	AACRNFAKDQ	ASRKSYISGN	VNCGVLNGNG
TKFSRSGHTS	FFDKGAVNGF	DPAPPPPGLG	SSRPSSAPGM	LPLSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Morris J.A., Kandpal G., Ma L., Austin C.P. (2003). DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) is a centrosome-associated protein that interacts with MAP1A, MIPT3, ATF4/5 and NUDEL: regulation and loss of interaction with mutation. Hum. Mol. Genet. 12: 1591—1608. PMID 12812986 DOI:10.1093/hmg/ddg162
Vergnolle M.A.S., Taylor S.S. (2007). Cenp-F links kinetochores to Ndel1/Nde1/Lis1/dynein microtubule motor complexes. Curr. Biol. 17: 1173—1179. PMID 17600710 DOI:10.1016/j.cub.2007.05.077

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17620 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9GZM8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.