NEDD8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1NDD, 1R4M, 1R4N, 1XT9, 2BKR, 2KO3, 2NVU, 3DBH, 3DBL, 3DBR, 3DQV, 3GZN, 4F8C, 4FBJ, 4HCP, 4P5O

Ідентифікатори

Символи

NEDD8, NEDD-8, neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, NEDD8 ubiquitin like modifier

Зовнішні ІД

OMIM: 603171 MGI: 97301 HomoloGene: 4485 GeneCards: NEDD8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • protein tag
Клітинна компонента	• гіалоплазма • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• GO:0034613 protein localization • anatomical structure morphogenesis • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • GO:1904578 response to organic cyclic compound • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein neddylation • protein deubiquitination • cellular iron ion homeostasis • Убіквітин-залежний протеоліз • посттрансляційна модифікація • modification-dependent protein catabolic process • regulation of proteolysis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4738


18002

Ensembl


ENSG00000129559 ENSG00000285246


ENSMUSG00000010376

UniProt


Q15843


P29595

RefSeq (мРНК)


NM_006156


NM_008683

RefSeq (білок)


NP_006147


NP_032709

Локус (UCSC)

Хр. 14: 24.22 – 24.23 Mb

Хр. 14: 55.9 – 55.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NEDD8 (англ. Neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 81 амінокислот, а молекулярна маса — 9 072^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLIKVKTLTG		KEIEIDIEPT		DKVERIKERV		EEKEGIPPQQ		QRLIYSGKQM
NDEKTAADYK		ILGGSVLHLV		LALRGGGGLR		Q

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liakopoulos D., Buesgen T., Brychzy A., Jentsch S., Pause A. (1999). Conjugation of the ubiquitin-like protein NEDD8 to cullin-2 is linked to von Hippel-Lindau tumor suppressor function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 5510—5515. PMID 10318914 DOI:10.1073/pnas.96.10.5510
Kamitani T., Kito K., Nguyen H.P., Yeh E.T.H. (1997). Characterization of NEDD8, a developmentally down-regulated ubiquitin-like protein. J. Biol. Chem. 272: 28557—28562. PMID 9353319 DOI:10.1074/jbc.272.45.28557
Wada H., Kito K., Caskey L.S., Yeh E.T.H., Kamitani T. (1998). Cleavage of the C-terminus of NEDD8 by UCH-L3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 251: 688—692. PMID 9790970 DOI:10.1006/bbrc.1998.9532
Kito K., Yeh E.T.H., Kamitani T. (2001). NUB1, a NEDD8-interacting protein, is induced by interferon and down-regulates the NEDD8 expression. J. Biol. Chem. 276: 20603—20609. PMID 11259415 DOI:10.1074/jbc.M100920200
Amir R.E., Iwai K., Ciechanover A. (2002). The NEDD8 pathway is essential for SCF(beta -TrCP)-mediated ubiquitination and processing of the NF-kappa B precursor p105. J. Biol. Chem. 277: 23253—23259. PMID 11953428 DOI:10.1074/jbc.M200967200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7732 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15843 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.