NFKBIB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1K3Z, 1OY3

Ідентифікатори

Символи

NFKBIB, IKBB, TRIP9, NFKB inhibitor beta

Зовнішні ІД

OMIM: 604495 MGI: 104752 HomoloGene: 37631 GeneCards: NFKBIB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• transcription, DNA-templated • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4793


18036

Ensembl


ENSG00000104825 ENSG00000282905


ENSMUSG00000030595

UniProt


Q15653


Q60778

RefSeq (мРНК)


NM_001001716 NM_001243116 NM_002503 NM_001369699 NM_001369700


NM_010908 NM_001306222

RefSeq (білок)


NP_001230045 NP_002494 NP_001356628 NP_001356629


NP_001293151 NP_035038

Локус (UCSC)

Хр. 19: 38.9 – 38.91 Mb

Хр. 7: 28.46 – 28.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFKBIB (англ. NFKB inhibitor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 37 771^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGVACLGKA	ADADEWCDSG	LGSLGPDAAA	PGGPGLGAEL	GPGLSWAPLV
FGYVTEDGDT	ALHLAVIHQH	EPFLDFLLGF	SAGTEYMDLQ	NDLGQTALHL
AAILGETSTV	EKLYAAGAGL	CVAERRGHTA	LHLACRVGAH	ACARALLQPR
PRRPREAPDT	YLAQGPDRTP	DTNHTPVALY	PDSDLEKEEE	ESEEDWKLQL
EAENYEGHTP	LHVAVIHKDV	EMVRLLRDAG	ADLDKPEPTC	GRSPLHLAVE
AQAADVLELL	LRAGANPAAR	MYGGRTPLGS	AMLRPNPILA	RLLRAHGAPE
PEGEDEKSGP	CSSSSDSDSG	DEGDEYDDIV	VHSSRSQTRL	PPTPASKPLP
DDPRPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Suyang H., Phillips R.J., Douglas I., Ghosh S. (1996). Role of unphosphorylated, newly synthesized IkappaB beta in persistent activation of NF-kappaB. Mol. Cell. Biol. 16: 5444—5449. PMID 8816457 DOI:10.1128/MCB.16.10.5444
Chu Z.L., McKinsey T.A., Liu L., Qi X., Ballard D.W. (1996). Basal phosphorylation of the PEST domain in the I(kappa)B(beta) regulates its functional interaction with the c-rel proto-oncogene product. Mol. Cell. Biol. 16: 5974—5984. PMID 8887627 DOI:10.1128/MCB.16.11.5974
Chen Y., Wu J., Ghosh G. (2003). KappaB-Ras binds to the unique insert within the ankyrin repeat domain of IkappaBbeta and regulates cytoplasmic retention of IkappaBbeta.NF-kappaB complexes. J. Biol. Chem. 278: 23101—23106. PMID 12672800 DOI:10.1074/jbc.M301021200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7798 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15653 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.